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CChapter2-生物降解的微生物基礎(chǔ)

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1、環(huán) 境 生 物 工 程 1 微生物生態(tài)及其對污染物的作用 環(huán)境工程的微生物學(xué)基礎(chǔ) Chapter 2 2.1 微生物多樣性 2.4 微生物的馴化 2.2 微生物的營養(yǎng) 2.5 常見污染物治理的微生 物操作技術(shù) 2.3 微生物對污染物的作用 FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 2 第二節(jié) 微生物的營養(yǎng) 營養(yǎng):生物體從外界攝取物質(zhì)和能量,滿足自身 生長和繁殖需要的一種生理功能。 類 型 碳源 能源 微生物舉例 光能自養(yǎng)菌 光能異養(yǎng)菌 化能自養(yǎng)菌 化能異養(yǎng)菌 CO2 有機(jī)物 CO2 有機(jī)物 光能 光能 無機(jī)還原物 有機(jī)物 藍(lán)細(xì)菌、紫 /綠硫細(xì)菌、藻 類 紫色非硫細(xì)菌

2、(紅螺菌科細(xì) 菌) 硝化細(xì)菌、硫化細(xì)菌、鐵細(xì) 菌、氫細(xì)菌 絕大多數(shù)細(xì)菌和全部的真核 微生物 FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 3 微生物的營養(yǎng)要求 六大要素: C、 N、 Energy、 GF、 H2O、 Mineral salts Carbon source: “細(xì)胞骨架 ” ,能生物降 解的菌可以利用多種有機(jī)物作為碳源。但 利用的能力不同: eg: Pseudomonas cepacia可以利用 90 種不同的有機(jī)物,而 Methanobacterium 僅僅利用 CO2和少數(shù) C1和 C2化合物。 FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境

3、生 物 工 程 4 Nitrogen source: 蛋白質(zhì)合成和核酸合成的必需物質(zhì)。 1. 環(huán)境中 N的存在形式:氮?dú)?、銨鹽、硝酸 鹽、尿素、有機(jī)含氮化合物等; 2. 微生物可以利用多種形式的氮源: 肺炎克雷伯氏菌:利用農(nóng)藥溴苯腈 氨 假單胞菌:二硝基苯酚 硝酸鹽 氨 3、有機(jī)污染環(huán)境中, N源是微生物種群的生 長限制因子。 污染物完全降解的碳氮比范圍: 200:1 10:1 FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 5 Growth factors: 主要是氨基酸 amino acid、嘌呤 purine、 嘧啶 pyridine、維生素 vitamin 需要的

4、量少,但有些微生物不能自身合成, 必需依賴外源提供,如乳酸菌必需提供多 種維生素的供應(yīng)。 Auxoautotroph:生長素自養(yǎng)型 Auxoheterotroph:生長素異養(yǎng)型 FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 6 Mineral salts: 微生物生長需要多種礦質(zhì)元素: Macroelements常量元素:構(gòu)成生物分子成 分,如磷是核酸、細(xì)胞膜的重要成分,硫是 蛋氨酸、硫胺素的成分,這些元素有 P、 S、 K、 Mg、 Ca、 Na、 Fe,濃度 10 4 10 3mol/L; Microelements微量元素: Cu、 Zn、 Mn、 Co、 Mo,

5、濃度 10 8 10 6mol/L;酶代謝 中起作用。 FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 7 自然環(huán)境中礦質(zhì)元素含量較高,但是少數(shù)難 溶的礦質(zhì)如磷,成為水環(huán)境和土壤環(huán)境中的 限制因子 。 一般要求碳磷比的范圍: 1000:1100:1 用 C/N和 C/P來評判環(huán)境的營養(yǎng)狀況要謹(jǐn)慎! FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 8 水: 一般用 水活度 ( Water activity, Aw)或 水勢 ( water potential, )來表示微生物可利用的水。 水活度 水活度事實(shí)上與平衡相對濕度含義一致,但它不是 以 0 1

6、00%RH標(biāo)志 ,而是以 0 .1.0 Aw標(biāo)志。平衡濕 度定義為沒有了物質(zhì)與空氣中水的交換情況下,由 周圍空氣獲取的濕度值。 水勢 某一系統(tǒng)中水的化學(xué)勢與處于相同溫度和壓力的純 水的化學(xué)勢之差,除以水的偏摩爾體積所得的商。 它是水分轉(zhuǎn)移本領(lǐng)大小的指標(biāo)。 水總是從水勢高的一方流向水勢低的一方。 FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 9 一般微生物需要水活度在 0.900 1.000范 圍內(nèi)存活,除了極少數(shù)菌體如 Halobacter外 。 水活度值和細(xì)菌繁殖 aw = 0.91 0.95 細(xì)菌最多 aw = 0.88 酵母最多 aw = 0.80 霉菌最多 aw

7、 = 0.75 喜鹽細(xì)菌 aw = 0.70 osmiophile某些酵母 aw = 0.65 xerophile 某些霉菌 FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 10 第三節(jié) 微生物對污染物的作用 微生物對污染物的作用是多方面的。包括: 降解作用,共代謝作用,去毒作用,激活 作用。 FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 11 1.微生物的降解作用 降解微生物 種類繁多,細(xì)菌、真菌、藻類 1)細(xì)菌 降解污染物的主力軍, 29類,廣泛對污染 物產(chǎn)生降解,包括真細(xì)菌、藍(lán)細(xì)菌和古菌 FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境

8、生 物 工 程 12 2)真菌 酵母、霉菌、大型真菌對污染物都有降解。 種類 種屬 代表污染物 酵母 Candida Saccharomyces Trichosporon Rhodotorula 石油烴 石油烴,克菌丹等 石油烴 石油烴 霉菌 Aspergillus Botrytis Cladosporium Cunninghamella 石油烴,敵百蟲 石油烴、撲草凈 石油烴、撲草凈 石油烴、甲霜靈 白腐菌 平革菌 云芝 PAHs/TCDD PCP FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 13 藻類 自然界藻類和菌類共棲,降解有機(jī)物。如氧 化塘。 藻類降解: A

9、、多種酚類化合物(苯酚、鄰甲酚、苯三酚 等)、萘。 B、偶氮染料:小球藻對 33種偶氮染料脫色 能力。 FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 14 2.基質(zhì)代謝的生理過程 微生物降解基質(zhì)過程和其他化合物的代謝 相似: 向基質(zhì)接近 對固體基質(zhì)吸附 分泌胞外酶 可滲透物質(zhì)的吸收和胞內(nèi)代謝 FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 15 向基質(zhì)接近 接近的意思:微生物處在這種物質(zhì)的可擴(kuò)散 范圍內(nèi),或者胞外酶處于這種范圍內(nèi)。 細(xì)菌和其他微生物表現(xiàn)出向基質(zhì)的趨向性。 如:絲狀真菌向基質(zhì)生長,擔(dān)子菌的探查環(huán) 境行為。 對固體基質(zhì)的吸附 微生物和固

10、體基質(zhì)間有非常緊密地結(jié)合 如:纖維素分解菌吸附纖維素,瀝青降解菌 牢固附著。 FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 16 胞外酶的分泌 天然和人工合成的大分子物質(zhì)都難降解,生 物采取分泌胞外酶來達(dá)到降解作用。 胞外酶活動失效的原因: 1)酶被吸附; 2)變性; 3)被生物降解; 4)分解產(chǎn)物被競爭生物利用。 FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 17 細(xì)胞內(nèi)代謝 異生素進(jìn)入細(xì)胞后,可以通過周邊代謝途徑 被降解。 初始代謝產(chǎn)物通常匯集到少數(shù)中央代謝途徑, 參與細(xì)胞成分構(gòu)建。 副反應(yīng)產(chǎn)物:代謝產(chǎn)生的副反應(yīng)產(chǎn)物可能產(chǎn) 生 終死產(chǎn)物 和

11、致死性產(chǎn)物 。終死產(chǎn)物本身 就是持久性的,若無其他生物代謝,將是 有害的;致死性產(chǎn)物就是代謝過程中產(chǎn)生 的產(chǎn)物抑制生物體生命循環(huán)的關(guān)鍵步驟使 得細(xì)胞死亡。如:氟代乙酸鹽是由氟取代 的基質(zhì)降解形成,抑制 TCA循環(huán)。 FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 18 測定出不同基質(zhì)條件下有機(jī)化合物的半衰期,這 些與環(huán)境因素關(guān)系很大。 類別 半衰期 生物降解快 17天 生物降解較快 728天 生物降解慢 424周 抗生物降解 612月 FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 19 2.共代謝 現(xiàn)象: 1960s,一氯乙酸上生長的假單胞 菌使三

12、氯乙酸脫鹵,卻不能利用三氯乙酸 微生物不能從共代謝中受益,在純培養(yǎng)中, 共代謝 終死轉(zhuǎn)化 FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 20 共代謝基質(zhì)與共代謝微生物 許多化合物在培養(yǎng)物中行共代謝。如:環(huán)己 烷、氯酚、二氯苯胺、三硝基苯、甲草胺、 禾草敵、 2, 4 D。 微生物:無色桿菌屬、節(jié)桿菌屬、假單胞菌 屬、黃桿菌屬、產(chǎn)堿菌屬、諾卡氏菌屬、芽 孢桿菌屬;青霉屬、絲核菌屬等 共代謝轉(zhuǎn)化涉及單個或多種酶,進(jìn)行羥基化、 氧化、去硝基、去氨基、水解、?;茸饔?。 FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 21 共代謝的原因 ( 1)缺少進(jìn)一步

13、降解的酶系 ( 2)中間產(chǎn)物的抑制作用 最初的轉(zhuǎn)化產(chǎn)物抑制了后續(xù)酶的活性。 例如:惡臭假單胞菌共代謝形成 3-氯兒茶酚, 抑制了后續(xù)酶系活性導(dǎo)致不能降解。 2 BA Cc e l lECODCBA a cba FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 22 ( 3)需要另外的基質(zhì) 需要第二種基質(zhì)因?yàn)椋嚎商峁╇娮庸w或者 起誘導(dǎo)作用。 如:銅綠假單胞菌要經(jīng)過正庚烷誘導(dǎo)產(chǎn)生羥 化酶系,使鏈烷烴轉(zhuǎn)化為相應(yīng)的醇。 FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 23 共代謝的環(huán)境意義 共代謝是微生物轉(zhuǎn)化的一種特殊類型,會造 成不良的環(huán)境影響: a.進(jìn)行

14、共代謝的微生物數(shù)量在環(huán)境中不增加, 物質(zhì)轉(zhuǎn)化率降低。 b.共代謝使有機(jī)產(chǎn)物持久積累,母體的毒性 不能消除。 FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 24 3.去毒作用 去毒作用:污染物分子結(jié)構(gòu)改變,降低或 去除對敏感物種的有害性。 去毒的酶反應(yīng)通常在細(xì)胞內(nèi)進(jìn)行,形成的 產(chǎn)物通常有三種轉(zhuǎn)歸: a.直接分泌到胞外; b.經(jīng)過一步或多步反應(yīng),進(jìn)入正常代謝途徑, 然后以有機(jī)廢物的形式分泌或: c.最后碳以 CO2的形式釋放出來。 FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 25 典型反應(yīng): ( 1)水解反應(yīng):酯鍵或酰胺鍵水解使得毒物脫毒 ( 2)

15、羥基化作用:在苯環(huán)或脂肪鏈上羥基化,使毒物失去 毒性 ( 3)脫鹵作用:脫鹵酶使工業(yè)廢物含鹵化合物轉(zhuǎn)化為無毒 產(chǎn)物。 ( 4)去甲基 or去烷基:許多殺蟲劑中與 N、 S、 O相連的甲 基或烷基脫去后,變成無毒。 ( 5)甲基化:有毒酚類加入甲基鈍化。 2 HORR C O O HOHR C O O R R O HRH H C lC H RR C HC H C LRR C H H C lRHR C l H C lR O HR C l H OH 2 2 2 3R O CHR O H FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 26 ( 6)硝基還原:硝基化合物對各種高等

16、 or低等生 物都是有害的,還原后毒性減輕: RNO2 RNH2 ( 7)去氨基: 如:有毒殺草劑醚草通脫氨形成對植物無毒害的 產(chǎn)物。 ( 8)醚鍵斷裂: 如:鹵代苯氧羧酸類除草劑醚鍵斷裂消除對植物 毒性。 ( 9)腈轉(zhuǎn)化為酰胺 ( 10)軛合作用( conjugation):生物體中間代 謝產(chǎn)物和異生素可進(jìn)行合成反應(yīng),稱為軛合作用。 產(chǎn)物一般無毒性。 FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 27 4.激活作用 激活作用及其特點(diǎn): 致癌物 致畸物 致突變物 急性毒物 毒植物素 抗菌素 迅速礦 化 活 化 緩慢礦化 無 毒 化 合 物 持久性 FEL,bio-vax

17、 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 28 激活作用的起始研究:某些農(nóng)藥本身不對靶標(biāo)生物 有害,只有進(jìn)入體內(nèi)以后分子結(jié)構(gòu)發(fā)生改變,才會 對生物體引起傷害和死亡。 激活反應(yīng): ( 1)脫鹵作用:三氯乙烯( TCE)在微生物降解過 程中發(fā)生激活,產(chǎn)生強(qiáng)致癌物 氯乙烯。厭氧代 謝還可形成 1, 1二氯乙烯和反 -1, 2-二氯乙烯。 22 CHC l H CC H C lCCl FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 29 ( 2)亞硝胺的形成: 亞硝胺類化合物的基本結(jié)構(gòu)為: 很強(qiáng)的致癌、致畸、和致突變物。 通過仲胺的 N-亞硝化作用形成。 a.仲胺和叔胺:工

18、業(yè)大量應(yīng)用,河水、廢水、土 壤普遍存在。叔胺經(jīng)過脫烷基形成仲胺。 b.亞硝酸鹽形成:自然界含量低,經(jīng)過氨氧化成 硝酸鹽,再經(jīng)反硝化作用形成亞硝酸鹽。 c.亞硝胺形成:環(huán)境中極低的亞硝酸鹽足以激活 反應(yīng): N N R R O N N R R O H 2 O R R N H N O 2 - + FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 30 凡是合成的就是危險的,凡是天然的就是安全的。 植物和魚體中都含有仲胺、叔胺 消化道內(nèi)微生物轉(zhuǎn)化使叔胺 仲胺,并使飲水和蔬 菜中的硝酸鹽 NO2- 微生物作用 or在低 pH值的胃內(nèi)經(jīng)非生物作用形成 亞硝胺 FEL,bio-vax 環(huán)

19、 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 31 ( 3)環(huán)氧化作用:微生物可以使一些帶雙鍵的化 合物形成環(huán)氧化物,使得產(chǎn)物對動物更有毒性 ( 4)硫代磷酸酯轉(zhuǎn)化為磷酸酯: 激活反應(yīng)在動物體內(nèi) or自然界中發(fā)生,氧化脫硫 造成的毒性增強(qiáng)可高達(dá) 1萬倍,如毒蟲畏激活后, 氧化脫硫形成強(qiáng)烈的膽堿酯酶抑制劑。 R O R O P S O X R O R O P O X O FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 32 其他激活方式有: 苯氧羧酸的代謝、硫醚的氧化、酯的水 解、甲基化、去甲基化等 激活的作用類型: a.典型激活:產(chǎn)物比前體物質(zhì)更具有毒性; b.緩解 一種化

20、合物有兩種前途:變成毒性即 激活;轉(zhuǎn)化為無毒產(chǎn)物,從而避免了激活, 稱為緩解。 c.生物毒性譜的變化:結(jié)構(gòu)改變對另一種生 物有害 FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 33 第四節(jié) 微生物的馴化 馴化及其在污染物處理中的應(yīng)用 土壤和水體受到污染后,特別在受到不容易 生物降解的有機(jī)物污染后,污染物開始不 發(fā)生降解或降解很慢,經(jīng)過一段時間后污 染物會迅速降解。 馴化期 ( acclimation period) :從污染物進(jìn)入 環(huán)境到污染物開始迅速降解的時間間隔。 又稱:適應(yīng)期( adaptation period) ,停滯期 ( lag period) FEL,b

21、io-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 34 馴化期長短變化很大,時間取決于化學(xué)品 的種類、化學(xué)品的濃度以及環(huán)境條件。 化學(xué)品 環(huán) 境 馴化期 4硝基酚 水沉積物 40 80h 五氯酚 河水 21 35天 二硝酚 土壤 16天 氯代苯類 生物膜 10天 5個月 次氨基三乙酸 河口 50天 殺草強(qiáng) 土壤 7天 苯胺靈 土壤 20天 FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 35 馴化:定向選育,即通過人工措施使微生 物逐步適應(yīng)某種特定條件,最后獲得具有 較高耐受力和代謝活性的菌株。 原始菌株 靶化合物 靶化合物 靶化合物 高活性菌株 濃 度 逐 漸

22、 增 加 FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 36 馴化的后效應(yīng) 馴化期的結(jié)束標(biāo)志著降解的開始。 降解某種化學(xué)品的微生物群落馴化出來, 能保持一段時期的活性。 不是所有的化合物都有馴化后效應(yīng)??赡?原因?化學(xué)品濃度太低。 例: 4硝基苯酚的馴化后 效應(yīng):在含有沉積物和天然 水的樣品中濃度高于 10g/L 才能降解,否則無法降解。 C10g/L C1 10g/L FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 37 農(nóng)藥加速降解 現(xiàn)象: 單一或反復(fù)使用某種殺蟲劑、殺菌 劑或除草劑,對有害生物的控制失效。 為什么? 1、抗藥性產(chǎn)生; 2、化學(xué)

23、品迅速降解 農(nóng)藥加速降解 ( accelerated pesticide degradation), 促進(jìn) 生物降解 ( enhanced microbial degradation) FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 38 問題的產(chǎn)生由于馴化期長度和降解速率發(fā) 生了變化。 為了延長農(nóng)藥作用期,需要使用延緩劑 抑制生物降解菌 有些農(nóng)藥沒有此類問題:如毒死蜱、異丙 隆等 施用過的土壤比從未施用的土壤更迅速的 礦化農(nóng)藥 FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 39 影響馴化的因素 1. 一種基質(zhì)馴化出的微生物群落經(jīng)常同時馴 化出降解

24、部分有關(guān)結(jié)構(gòu)分子的 群落 。 2. 環(huán)境因子影響馴化期的長短。如:溫度、 pH、通氣狀況、 N、 P、等等 3. 代謝化合物的濃度。微量濃度的化學(xué)品的 生物降解速率隨濃度增加而提高,但濃度 越高馴化期越長。 4. 微生物區(qū)系差異。同一種化學(xué)品在同一濃 度下,隨地點(diǎn)不同馴化期差異很大。 FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 40 產(chǎn)生馴化期的原因 對馴化期的認(rèn)識,早期建立在純培養(yǎng)基礎(chǔ)上。 不足之處:純培養(yǎng)的細(xì)菌濃度遠(yuǎn)遠(yuǎn)超過自然界 單個種群密度。 重新設(shè)計的實(shí)驗(yàn)來驗(yàn)證假說,結(jié)果一些新的解 釋如下: 1. 群體數(shù)量太少與檢測的靈敏度不夠 2. 毒物的存在 3. 原生動

25、物的捕食作用 4. 新的基因型的出現(xiàn) 5. 二次生長 6. 酶的誘導(dǎo)和停滯期 FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 41 1.群體數(shù)量太少和檢測靈敏度不夠 土壤、天然水、污水和廢水環(huán)境中能夠利 用合成有機(jī)化合物生長的微生物群體數(shù)量 是很少的,有時甚至只有幾個。 即使是幾個細(xì)胞在旺盛的代謝污染物,但不 會被觀察到明顯的濃度下降和細(xì)胞增加。 只有細(xì)胞分裂進(jìn)入指數(shù)期,母體化合物濃度 的下降才會被觀察到。 有機(jī)物初始濃度越高,經(jīng)歷的停滯期越長! FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 42 2.毒物的存在 抑制劑的存在影響了馴化期。 1.

26、化學(xué)品濃度很高,只有很少的微生物可以 降解; 2. 很多污染點(diǎn)都是有毒化學(xué)品的混合物,抑 制了微生物的降解。 地下水污染的羽狀帶,由于污染物流出使 抑制劑稀釋而發(fā)生降解。 FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 43 毒物有幾種方式讓馴化期延長或縮短 i. 單純抑制 :如重金屬抑制降解 NTA,使得 活性淤泥的馴化期延長; ii. 抑制快生菌 :毒物抑制快生菌,通常使降 解污染物的混合種群的優(yōu)勢菌株。 iii. 毒性產(chǎn)生:毒性最初不存在,在降解過程 產(chǎn)生。 如:在苯酚和 4硝基苯酚共存,苯酚 的降解受到 4硝基苯酚降解產(chǎn)物的抑制 iv. 毒性消除 毒性消除后降解菌

27、能夠繁殖, 馴化期為 2段時間之和。 FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 44 原生動物的捕食作用 實(shí)驗(yàn)證明:設(shè)置對照組,添加真核抑制劑, 發(fā)現(xiàn)馴化期縮短 真核生物的存在抑制了 菌群? 捕食作用不明顯的地方,如許多天然水體, 馴化期不受真核抑制劑的影響。 FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 45 新的基因型的出現(xiàn) 突變、種間基因轉(zhuǎn)移會導(dǎo)致發(fā)生遺傳改變。 新基因型產(chǎn)生后,若該選擇是有利的,降 解菌就會大量繁殖。 馴化反映的是突變或基因轉(zhuǎn)移發(fā)生的時間 與新降解菌繁殖達(dá)到高種群密度的總和。 假單胞菌 產(chǎn)堿菌 降解氯兒茶酚 基因轉(zhuǎn)移

28、FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 46 二次生長 二次生長產(chǎn)生的原因:微生物對不同基質(zhì) 的利用有先后選擇。 較容易利用的基質(zhì)被優(yōu)先利用:大腸桿菌 對葡萄糖、山梨糖混合液的利用;假單胞 菌對無機(jī)磷和有機(jī)磷混合液的利用。 FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 47 酶的誘導(dǎo)和停滯期 許多參與異生素分解的最初幾步酶都是誘 導(dǎo)酶。 誘導(dǎo)在幾分鐘或者幾個小時內(nèi)完成,馴化 期需要幾天到幾周。 誘導(dǎo)酶的產(chǎn)生與基質(zhì)濃度有關(guān)。 FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 48 2.3 微生物操作技術(shù) 1、菌株接種 接種

29、目的:生物強(qiáng)化作用 加速污染物的降解(對時間嚴(yán)格要求時) 克服降解微生物的不均勻性 縮短馴化期 恢復(fù)微生物區(qū)系:污染高濃度、高溫度或 其他條件抑制天然降解物種增長 FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 49 接種注意點(diǎn) a) 無須接種:條件有利,天然區(qū)系存在,時 間充裕 b) 接種失效:不適合降解微生物生存的條件 典型事例 烴類降解混合菌投入海水系統(tǒng),并不能促進(jìn)污染 降解 FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 50 2、菌株的富集和分離 富集培養(yǎng)技術(shù)是一種常用的選擇性培養(yǎng)技術(shù)。 選擇生長因子造成特殊環(huán)境選擇優(yōu)勢微生物。 唯一碳源

30、or能源 必需無機(jī)鹽 其他條件控制 富集培養(yǎng) FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 51 3、異生素降解菌富集和分離的困難及其 解決方法 a)異生素的特點(diǎn):高毒性、非水溶性、高揮發(fā)性 和熱不穩(wěn)定性 降解菌分離困難,因?yàn)橛行┛芍苯託缥⑸铮?如低分子量溶劑、醛、酚類 b)問題的處理方法: 毒性:強(qiáng)毒性的可以低濃度維持;水溶性差的 可以高濃度保持。 憎水性:通過分散作用或使用惰性親水載體。 具體方法:高速攪拌、超聲波乳化、硅藻土 吸附等 FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 52 揮發(fā)性:適當(dāng)封閉體系,注意及時補(bǔ)充 熱穩(wěn)定性:熱不穩(wěn)

31、定異生素不可用常規(guī)方 法加熱滅菌,過濾消毒(有機(jī)溶劑類過濾 會破壞硝化纖維素膜和聚碳酸酯膜,只能 用燒結(jié)陶瓷膜或燒結(jié)金屬膜過濾) 高毒性物質(zhì)雖自身可以殺菌,但最好過濾除 菌 FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 53 4、異生素降解菌富集和分離技術(shù) 富集分離的難度 常規(guī)微生物的富集分離可以直接挑選,而異 生素降解菌則不然,因?yàn)椋?a、生長緩慢,不易區(qū)分; b、補(bǔ)充的外源有機(jī)物增加了復(fù)雜性; c、不溶性異生素影響濁度觀察。 FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 54 可行方法: 殘留分析和生長狀況判斷 降解實(shí)驗(yàn)要分析異生素殘留狀況:

32、 異生素 憎水性 萃 取 氣/ 液 相 色 譜 化 學(xué) 反 應(yīng) 測 定 鹵 素 分 析 14C 標(biāo) 記 生物呼吸儀 FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 55 降解菌落的選擇 利用生理特征來挑選:如形成透明帶、 指示劑變色、特殊顏色反應(yīng)等; 菌 落 觀 察 技 術(shù) 透明圈形成:雙層瓊脂技術(shù) 制備好的 礦物瓊脂支持平板上傾倒乳化好的異生素瓊脂, 用以觀察透明帶 顯色劑添加:利用顯色反應(yīng) , 如降解氯代苯 胺 偶氮苯,可用茴香胺雙氧水噴灑,紅色褪 去者為降解菌落 酸堿指示劑: 有機(jī)氯的降解菌,加入酸堿指 示劑如伊紅、美藍(lán)、溴甲酚紫、溴百里酚藍(lán),可 以檢測到顏色變化

33、FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 56 5、共代謝基質(zhì)降解菌的富集和分離 共代謝基質(zhì)降解菌的富集分離是困難的, 因?yàn)楣泊x是不與微生物生長相聯(lián)系的基 質(zhì)降解過程,不能使用降解基質(zhì)作為唯一 碳源富集。 解決途徑:用類似物富集和測定富集菌中 有關(guān)的酶系。 FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 57 1類似物富集 使用類似物可以加速共代謝基質(zhì)分解。以此 原理進(jìn)行分離。 優(yōu)點(diǎn):容易操作,有定向性; 缺點(diǎn):不是總有效,要多多試驗(yàn)。 2相關(guān)酶的測定 了解共代謝性質(zhì)后,可以通過測定特定的酶 來篩選菌株,來得到降解菌。 FEL,bio-vax

34、 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 58 同生菌的富集和分離 同生菌 異生素上述方法失敗 原因? 濃度? 生長因子缺乏 純培養(yǎng)技術(shù)的缺陷 FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 59 另一現(xiàn)象: 富集培養(yǎng)降解速率提高,但單一碳源在人工 培養(yǎng)時生長緩慢,轉(zhuǎn)管幾次后生長停止。 為何? 培養(yǎng)基缺乏營養(yǎng); 同生菌降解任務(wù)。 同生菌微生物的關(guān)系: 互養(yǎng)、協(xié)同共棲 FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 60 有效分離手段:恒化器 FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 61 “加速進(jìn)化”與富集分離 在選

35、擇壓力存在的恒 化器中長期混合培養(yǎng) 微生物,通過各種微 生物間質(zhì)粒的自然傳 遞和相互作用來完成 構(gòu)建新菌株的目的, 又稱為 ” 質(zhì)粒協(xié)助分 子育種 ” 。 A B C waste FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 62 接種試驗(yàn)成功案例 在反應(yīng)器中加入純培養(yǎng)、富集物或混合菌 株降解異生素容易獲得成功 土壤、含水層、地表水環(huán)境中成功的事例 不多 1、土壤:農(nóng)藥石油類以及一些特殊烴類 有:對硫磷 假單胞菌 苯胺靈 混合細(xì)菌 石油類 假絲酵母 硝基酚 混合菌株 FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 63 2、其他環(huán)境 ( 1)水體

36、河口獲得的烴類降解菌可促進(jìn) 石油泄漏污染,接種可促進(jìn)海濱石油污染, 如將降解 PAHs的分支桿菌接種到水體可以 促進(jìn)芘的礦化。 ( 2)活性淤泥系統(tǒng) 有代謝多樣的微生物,但對許多新的合成化 合物的馴化期過長,接種可加速降解。 FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 64 接種失敗的原因 經(jīng)??梢砸姷浇臃N失敗的例子:海水中分 解石油烴的菌株接種到淡水中不起作用; 土壤中可利用脂肪烴的細(xì)菌接種到燃料油 污染的土壤,不促進(jìn)降解 反映了引入的微生物受到多種生態(tài)因子限 制。 1. 營養(yǎng)限制 大量微生物在有機(jī)污染的水體 中競爭無機(jī)鹽,導(dǎo)致快速生長的非降解菌 占優(yōu)勢。證據(jù):接種

37、體在滅菌條件下可以 分解污染物,而在非滅菌的自然環(huán)境中不 能分解的現(xiàn)象。 FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 65 2、捕食者和寄生物的抑制 環(huán)境中的捕食者和寄生物對細(xì)菌的抑制, 如 原生動物捕食多種細(xì)菌,要求細(xì)菌密 度在 106個 /ml(g). 證據(jù):硝基苯利用菌 Corynebacterium spp. 對 4-硝基苯酚降解,接種到低濃度湖水中 數(shù)目下降,加入抑制原生動物和真核生物 的放線菌酮,降解正常數(shù)量增加。 FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 66 3.細(xì)菌在土壤中的移動能力 一般土壤表面施用的接種物在土壤中移動不超過 5cm,通過土壤孔隙水分?jǐn)U散,移動也不顯著。 通過對糞大腸桿菌的研究證實(shí),細(xì)菌移動不超過化 糞池區(qū)域 10米。 另有研究認(rèn)為細(xì)菌通過 裂隙基巖至少移動 30米 FEL,bio-vax 環(huán) 境 生 物 工 程 環(huán)境 生 物 工 程 67 4、其他原因 a 其他碳源的存在 微生物對易用碳源的利用降低污染物代謝 能力 b 有機(jī)基質(zhì)濃度太低 c 需要添加額外碳源支持生長 共代謝微生 物 d 溫度 e pH值 f 鹽分:海水分離的菌不能降解淡水石油 g 毒物 天然抑制物

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