動物生物化學(xué) 復(fù)習(xí)知識點(diǎn)
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1、 第一章 緒 論 1、 生物化學(xué)的概念 在分子水平上研究生命現(xiàn)象的化學(xué)本質(zhì)的科學(xué)。它以生物體為研究對象,包括人體、動物、植物、微生物和病毒。 2、生物化學(xué)的研究內(nèi)容與發(fā)展的三個(gè)階 (1)靜態(tài)生物化學(xué)階段(20世紀(jì)20年代之前 (2)動態(tài)生物化學(xué)階段(20世紀(jì)前半葉 (3)機(jī)能生物化學(xué)階段(20世紀(jì)50年代以后 3、生物化學(xué)與畜牧獸醫(yī)的關(guān)系 v 在畜禽飼養(yǎng)中深刻理解畜禽機(jī)體內(nèi)物質(zhì)代謝和能量代謝的狀況,掌握體內(nèi)營養(yǎng)物質(zhì)代謝間相互轉(zhuǎn)變及相互影響的規(guī)律是提高飼料營養(yǎng)作用的基礎(chǔ)。 v 掌握正常畜禽的代謝規(guī)律,對于臨床上畜禽代謝疾病的癥斷與治療具有主要的作用。 第二章 蛋白質(zhì)的結(jié)
2、構(gòu)與功能 一、蛋白質(zhì)的分類 1.按蛋白質(zhì)的構(gòu)象分類:球狀蛋白質(zhì) 纖維狀蛋白質(zhì) 2.按蛋白質(zhì)的功能分類:催化蛋白(酶) 運(yùn)輸?shù)鞍祝ㄟ\(yùn)輸和轉(zhuǎn)運(yùn)物質(zhì),如血紅蛋白,脂蛋白,各種泵) 貯藏蛋白(儲藏物質(zhì),如鐵蛋白,酪蛋白) 收縮蛋白(肌肉收縮運(yùn)動,如肌球蛋白,肌動蛋白) 防御蛋白(防護(hù)和免疫,如各種免疫球蛋白) 結(jié)構(gòu)蛋白(細(xì)胞骨架結(jié)構(gòu),如膠原蛋白,角蛋白) 調(diào)節(jié)蛋白(調(diào)節(jié)功能,如胰島素,生長素) 電子傳遞蛋白 3.按蛋白質(zhì)的組成和溶解性分類:簡單蛋白質(zhì) 結(jié)合蛋白質(zhì) 二、 蛋白質(zhì)的化學(xué)組成 一)、蛋白質(zhì)的元素組成:凱氏定氮法:例子 蛋白質(zhì)元素組成的一個(gè)特點(diǎn):其中N是區(qū)別
3、糖和脂的特征元素,各種蛋白質(zhì)的氮含量比較恒定,平均值為16%左右,這是凱氏定氮法測蛋白質(zhì)含量的理論依據(jù): 蛋白質(zhì)含量=蛋白質(zhì)含N量×6.25(蛋白系數(shù)) (二)、構(gòu)成蛋白質(zhì)的基本結(jié)構(gòu)單位 1、 氨基酸的結(jié)構(gòu): A、均為α-氨基酸(除脯氨酸);B、均為L-氨基酸(除甘氨酸) 2、氨基酸的分類:基本氨基酸(20種):掌握R基團(tuán)的結(jié)構(gòu)特征(色氨酸、組氨酸等)。營養(yǎng)學(xué)分類:必需氨基酸的種類 編碼氨基酸: 據(jù)R基團(tuán)極性分類 非極性R基團(tuán)AA(8種) 極性R基團(tuán)AA:不帶電荷(7種); 帶電荷:正電荷(3種)負(fù)電荷(2種) 據(jù)氨基酸的酸堿性分類
4、 中性AA:含脂肪烴:Gly、Ala、Val、Leu、Ile 含芳香環(huán):Phe、Tyr、Try 含羥基:Thr、Ser 含硫:Met、Cys 含亞氨基:Pro 含酰胺基:Asn、Gln 酸性AA:Asp、Glu 堿性AA:Lys、Arg、His 據(jù)營養(yǎng)學(xué)分類: 必需AA:Lys Trp Phe Val Met Leu Ile Thr 非必需AA 據(jù)代謝去向分類 生糖AA(15種) 生酮AA(1種:Leu 生糖兼生酮AA(4種:Ile,Lys,Phe,Tyr) 3、氨基酸的性質(zhì) A、氨基酸的兩性解離及等電點(diǎn):大于等電點(diǎn)帶負(fù)
5、電荷,小于帶正電荷;等電點(diǎn)的概念; (1)氨基酸的一般理化性質(zhì) · а-氨基酸是無色結(jié)晶,各有特殊晶形。 · 熔點(diǎn)極高(200℃-300 ℃左右),類似離子晶體。 · 各有不同味道(甜、苦、鮮等)。 · 除Cys、Try外,一般能溶于水;均溶于稀酸、堿,除Pro可溶于酒精、乙醚外,其余氨基酸均不溶于或少溶于有機(jī)溶劑。 對某種氨基酸來講,當(dāng)溶液在某一特定的 pH 時(shí),氨基酸所帶凈電荷為零(即正電荷數(shù)與負(fù)電荷數(shù)相等) ,在電場中,既不向正極移動,也不向負(fù)極移動。這時(shí)溶液的pH 稱為該氨基酸的等電點(diǎn),用pI表示。 氨基酸等電點(diǎn)的計(jì)算; 氨基酸等電點(diǎn)的作用: A、不同氨基酸,由于R
6、基團(tuán)結(jié)構(gòu)的不同,有不同的等電點(diǎn)。在一定實(shí)驗(yàn)條件下,等電點(diǎn)是氨基酸的特征常數(shù)。 B、當(dāng)氨基酸處于等電點(diǎn)狀態(tài)時(shí),其溶解度最小,容易發(fā)生沉淀。 利用這一特性,可以從各種氨基酸的混合物溶液中,分離制取某種氨基酸 B、氨基酸的光學(xué)活性與光吸收性質(zhì):旋光性,紫外吸收特征。 除甘氨酸以外,其余 20 種氨基酸的 Cα都是不對稱碳原子(手性),都具有旋光性。 在280nm處,Trp吸收最強(qiáng),Tyr次之,Phe最弱 三·1.肽鍵(peptide bond)和肽(peptide 肽鍵的結(jié)構(gòu)特點(diǎn):具有部分雙鍵性質(zhì),具有平面性,反式構(gòu)型。 二面角的概念:與N-C鍵相連的N-Cа和C
7、-Cа可以旋轉(zhuǎn).即兩相鄰酰胺平面之間,能以共同的Cα為定點(diǎn)而旋轉(zhuǎn),繞Cα-N鍵旋轉(zhuǎn)的角度稱φ角,繞C-Cα鍵旋轉(zhuǎn)的角度稱ψ角。φ和ψ稱作二面角,亦稱構(gòu)象角,可用于描述多肽的所有可能構(gòu)象。 2、多肽(polypeptide)和多肽鏈(polypeptide chain) 氨基酸順序、氨基端或N-端、羧基端或C-端、氨基酸殘基。 · 在多肽鏈中,氨基酸殘基按一定的順序排列,這種排列順序稱為氨基酸順序 · 通常在多肽鏈的一端含有一個(gè)游離的a-氨基,稱為氨基端或N-端;在另一端含有一個(gè)游離的a-羧基,稱為羧基端或C-端。 · 多肽鏈上不完整的氨基酸,稱為氨基酸殘基,它是研究蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)的最
8、小單位。 四、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)層次 基本結(jié)構(gòu):多肽鏈中氨基酸組成及排列順序 高級結(jié)構(gòu):二級結(jié)構(gòu)(多肽鏈主鏈局部空間構(gòu)象:а-螺旋:右手、左手 β-折疊:平行、反平行 β-轉(zhuǎn)角:松散肽段(無規(guī)卷曲) (超二級結(jié)構(gòu)):二級結(jié)構(gòu)單位的聚合(аа、 β×β、 βаβ) (結(jié)構(gòu)域):球蛋白分子中,由二級結(jié)構(gòu)組成,在空間 上可明顯區(qū)分的球狀聚集體 三級結(jié)構(gòu):多肽鏈中各原子間的空間關(guān)系 四級
9、結(jié)構(gòu):寡聚蛋白質(zhì)分子中各亞基的空間關(guān)系 五、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系 A、一級結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系:一級結(jié)構(gòu)相近的蛋白質(zhì),其功能類似性越大。一級結(jié)構(gòu)決定空間結(jié)構(gòu),而空間結(jié)構(gòu)與蛋白質(zhì)的生物功能直接有關(guān),一般來說,一級結(jié)構(gòu)通過高級結(jié)構(gòu)影響功能。 B、高級結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系:蛋白質(zhì)的高級結(jié)構(gòu),即空間構(gòu)象與其生物活性相對應(yīng),因此,高級結(jié)構(gòu)對其生物功能有直接影響。 注意理解各個(gè)例子:掌握一些概念:同功能蛋白、可變氨基酸殘基、不變氨基酸殘基、鐮刀型紅細(xì)胞貧血病 的概念及病因-由于正常血紅蛋白分子中的一個(gè)谷氨酸殘基被纈氨酸殘基所置換。 六·蛋白質(zhì)的重要性質(zhì) 1、蛋白質(zhì)的分子量 2、蛋白質(zhì)兩性解離性質(zhì)
10、和等電點(diǎn) 3、電泳:概念、遷移率、影響因素 4、蛋白質(zhì)膠體性質(zhì):穩(wěn)定因素;透析法;鹽析 5. 蛋白質(zhì)的沉淀的方法 6. 蛋白質(zhì)的變性與復(fù)性:變性的概念、機(jī)制、應(yīng)用等、復(fù)性的概念。 7、蛋白質(zhì)的紫外吸收光譜: 280nm處最大紫外吸 第三章 一、酶的一般概念:酶是一類由活性細(xì)胞產(chǎn)生的具有催化作用和高度專一性的特殊蛋白質(zhì)。簡單說,酶是一類由活性細(xì)胞產(chǎn)生的生物催化劑。 二、酶催化作用的特點(diǎn):特性:高度的專一性:絕對專一、相對專一、立體異構(gòu)專一 ;高的催化效率 三、酶的化學(xué)本質(zhì):核酶(ribozyme)的概念:但在80年代切克和阿爾特曼發(fā)現(xiàn)四膜蟲的L19RNA具有多種酶的催化功
11、能.這說明有催化作用的生物催化劑不一定是蛋白質(zhì).將這類具有催化作用的RNA稱為核酶(ribozyme). 四、酶的組成與輔酶:單純酶、結(jié)合酶:酶蛋白與輔助因子的作用、輔酶與輔基的區(qū)別、維生素的概念和作用、不同維生素的輔酶形式和作用。 單純酶::水解產(chǎn)物僅氨基酸,酶活性僅決定于它們的蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)。 輔酶:與酶蛋白部分結(jié)合較松,用透析法易于分離。如輔酶I(NAD)和輔酶II(NADP)是許多脫氫酶的輔酶,由煙酰胺和腺嘌呤核苷酸結(jié)合而成。 輔基:酶的輔因子或結(jié)合蛋白的非蛋白部分。與酶或蛋白質(zhì)結(jié)合非常緊密,用透析法不易除去。如細(xì)胞色素氧化酶的輔基鐵卟啉。 酶 蛋 白:決定底物的專一
12、性; 輔助因子:決定酶反應(yīng)的類型。 輔助因子與酶反應(yīng)的類型有關(guān),是酶表現(xiàn)催化活性所必需的,在催化反應(yīng)中往往起傳遞電子、原子和某些化學(xué)基團(tuán)的作用。 維生素(Vitamin)是機(jī)體維持正常生命活動所必需,人和動物不能合成或合成量極少,必需由食物供給的一類小分子有機(jī)物質(zhì)。 脂溶性維生素: A 視黃醇(維生素A原——胡蘿卜素) D 鈣化醇E 生育酚 K 凝血維生素 水溶性維生素:B族維生素和維生素C 作 用 它們主要作為酶的輔或輔酶對新陳代謝過程起著非常重要的調(diào)節(jié)作用。機(jī)體缺少某種維生素時(shí),可以使新陳代謝過程發(fā)生紊亂,產(chǎn)生維生素缺乏病
13、。 (1)維生素B族幾乎全部參與輔酶的組成 如維生素 Bl 、維生素B2(輔基) 、維生素 PP( B5)、維生素 B6、葉酸( B11 )、泛酸( B3)等。 (2)有些維生素本身就是輔酶 如維生素 C(抗壞血酸)、硫辛酸(是含硫脂肪酸類維生素)等。 五 、酶結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系 活性中心、必需基團(tuán)概念、酶原、酶原激活、酶原激活的機(jī)制(實(shí)質(zhì))、酶原激活的生理意義、 活性中心:酶分子上直接與底物結(jié)合并與其催化性能直接有關(guān)的一些基團(tuán)所構(gòu)成的微區(qū)。 必需基團(tuán):與酶的催化活性有關(guān)的所有基團(tuán) ? 酶原:沒有活性的酶的前體。 ? 酶原激活:酶原必須
14、經(jīng)過適當(dāng)?shù)那懈铍逆I,才能轉(zhuǎn)變成有催化活性的酶。無活性的酶原轉(zhuǎn)變成有活性的酶的過程,稱為酶原激活。 ? 酶原激活的機(jī)制為:酶原分子一級結(jié)構(gòu)的改變導(dǎo)致了酶原分子空間結(jié)構(gòu)的改變,使催化活性中心得以形成,故使其從無活性的酶原形式轉(zhuǎn)變?yōu)橛谢钚缘拿浮? ? 酶原激活的實(shí)質(zhì):酶原激活過程實(shí)質(zhì)上是酶活性中心組建、完善或者暴露的過程。 ? 酶原激活的生理意義在于:保護(hù)自身組織細(xì)胞不被酶水解消化。 六 、酶的作用機(jī)理:催化高效率機(jī)理:中間產(chǎn)物學(xué)說;酶作用專一性機(jī)理:鎖鑰學(xué)說、誘導(dǎo)契合學(xué)說。 中間產(chǎn)物學(xué)說的主要內(nèi)容 u 1)酶催化化學(xué)反應(yīng)的過程,實(shí)際上是酶對反應(yīng)物進(jìn)行化學(xué)作用的過程。在酶促反應(yīng)
15、的某一階段,酶分子與反應(yīng)物分子相互結(jié)合,并對反應(yīng)物分子的特定的化學(xué)鍵進(jìn)行作用。此時(shí)酶與底物形成一種相對穩(wěn)定的復(fù)合物。我們把這個(gè)酶與底物的復(fù)合物叫做中間產(chǎn)物。 u 2)酶與底物的復(fù)合物,即中間產(chǎn)物形成后,由于酶對底物分子某些化學(xué)鍵的作用,使底物發(fā)生化學(xué)作用,進(jìn)而轉(zhuǎn)變?yōu)楫a(chǎn)物。 u 3)酶促反應(yīng)速度的快慢,決定于中間產(chǎn)物的形成速度和濃度。中間產(chǎn)物形成的越快、越多,酶促反應(yīng)速度也就越快。 七、與酶的高效率有關(guān)的主要因 (1)、鄰近效應(yīng)和定向效應(yīng) (2)底物形變(張力學(xué)說) (3)、共價(jià)催化 (4)、酸堿催化 (5)活性部位疏水空穴的影響 八、酶活力測定:酶活力概念、 2、酶活力單位:
16、 國際單位(IU)、 Katal(Kat): 九、酶促反應(yīng)動力 酶促反應(yīng)動力學(xué)概念、初速 1、底物濃度對酶促反應(yīng)速度的影響:雙曲線,底物對酶的飽和、米氏方程式、米氏常數(shù)(特征性常數(shù))的含義及意義、米氏常數(shù)的計(jì)算,雙倒數(shù)做圖法:橫坐標(biāo)切點(diǎn)(-1/km,0);縱坐標(biāo)(0,1/VM)。 u 1913年,德國化學(xué)家Michaelis和Menten根據(jù)中間產(chǎn)物學(xué)說對酶促反映的動力學(xué)進(jìn)行研究,推導(dǎo)出了表示整個(gè)反應(yīng)中底物濃度和反應(yīng)速度關(guān)系的著名公式,稱為米氏方程。 1. 米氏常數(shù)的意義 (1) 當(dāng)ν=Vmax/2時(shí),Km=[S]。因此,Km等于酶促反應(yīng)速度達(dá)最大值一半時(shí)的底物濃度。 2)
17、Km可以反映酶與底物親和力的大小.Km越小,酶與底物的親和力越大。 (4). Km是酶的特征性常數(shù):在一定條件下,某種酶的Km值是恒定的,因而可以通過測定不同酶(特別是一組同工酶)的Km值,來判斷是否為不同的酶。 (5). Km可用來判斷酶的最適底物:當(dāng)酶有幾種不同的底物存在時(shí),通過測定酶在不同底物存在時(shí)的Km值,Km值最小者,即為該酶的最適底物。 2、抑制劑對反應(yīng)速度的影 (一)可逆抑制作用 竟?fàn)幮砸种疲焊偁幮砸种频母拍罴疤攸c(diǎn);磺胺藥的抑菌機(jī)理舉例: 非竟?fàn)幮砸种疲悍歉偁幮砸种频母拍罴疤攸c(diǎn); ? 競爭性抑制的特點(diǎn): ⑴ 競爭性抑制劑往往是酶的底物類似物或反應(yīng)產(chǎn)物; ⑵
18、抑制劑與酶的結(jié)合部位與底物與酶的結(jié)合部位相同; ⑶ 抑制劑濃度越大,則抑制作用越大;但增加底物濃度可使抑制程度減??; ⑷ 動力學(xué)參數(shù):Km值增大,Vm值不變。 ? 非競爭性抑制的特點(diǎn): ⑴ 非競爭性抑制劑的化學(xué)結(jié)構(gòu)不與底物的分子結(jié)構(gòu)類似; ⑵ 底物和抑制劑分別獨(dú)立地與酶的不同部位相結(jié)合; ⑶ 抑制劑對酶與底物的結(jié)合無影響,故底物濃度的改變對抑制程度無影響; ⑷ 動力學(xué)參數(shù):Km值不變,Vm值降低。 (二)不可逆抑制:有機(jī)磷農(nóng)藥中毒:乙酰膽堿酯酶是羥基酶(活性中心為絲氨酸的羥基,與有機(jī)磷農(nóng)藥共價(jià)結(jié)合后失活,使興奮性神經(jīng)遞質(zhì)乙酰膽堿不能及時(shí)清除降解。 、激活劑對反應(yīng)速度的影
19、響 4、酶濃度對反應(yīng)速度的影響 5、溫度對反應(yīng)速度的影響:最適溫度 6、溶液pH對反應(yīng)速度的影響:最適pH 十、酶 活 性 調(diào) 節(jié) 1、變 構(gòu) 酶(別構(gòu)酶):概念,變構(gòu)調(diào)節(jié)的機(jī)制。 具有變構(gòu)調(diào)節(jié)作用的酶就稱為變構(gòu)酶 ? 變構(gòu)酶一般是多亞基構(gòu)成的聚合體,一些亞基為催化亞基,另一些亞基為調(diào)節(jié)亞基。 ? 當(dāng)調(diào)節(jié)亞基與變構(gòu)劑結(jié)合后,就可導(dǎo)致酶的空間構(gòu)象發(fā)生改變,從而導(dǎo)致酶的催化活性中心的構(gòu)象發(fā)生改變而致酶活性的改變。 2、共價(jià)調(diào)節(jié)酶:概念,共價(jià)調(diào)節(jié)的機(jī)制 ? 酶蛋白分子中的某些基團(tuán)可以在其他酶的催化下發(fā)生共價(jià)修飾,從而導(dǎo)致酶活性的改變,稱為共價(jià)修飾調(diào)節(jié)。這種被修飾的酶稱為共價(jià)調(diào)節(jié)
20、酶。 ? 共價(jià)修飾的機(jī)制:共價(jià)修飾酶通常在兩種不同的酶的催化下發(fā)生修飾或去修飾,從而引起酶分子在有活性形式與無活性形式之間進(jìn)行相互轉(zhuǎn)變。 3、同 工 酶:概念,乳酸脫氫酶,2種亞基,組成5種四聚體,不同組織分布不同,其生理意義。 存在于同一種屬或不同種屬,同一個(gè)體的不同組織或同一組織、同一細(xì)胞,具有不同分子形式卻能催化相同的化學(xué)反應(yīng)的而在蛋白質(zhì)分子的結(jié)構(gòu)、理化性質(zhì)和免疫性能等方面都存在明顯差異的一組酶,稱之為同工酶 生理意義:適應(yīng)不同組織或不同細(xì)胞器在代謝上的不同需要。 ? 心肌中以LDH1含量最多,LDH1對乳酸的親和力較高,因此它的主要作用是催化乳酸轉(zhuǎn)變?yōu)楸嵩龠M(jìn)一步氧化分解
21、,以供應(yīng)心肌的能量。 ? 在骨骼肌中含量最多的是LDH5,LDH5對丙酮酸的親和力較高,因此它的主要作用是催化丙酮酸轉(zhuǎn)變?yōu)槿樗?,以促進(jìn)糖酵解的進(jìn)行。 十一 酶工程:概念,生物酶工程、化學(xué)酶工程 第四章 生物氧化 一、生物氧化概念:氧化還原反應(yīng)的共同特征;歷程不同;特點(diǎn):生物氧化是在活細(xì)胞內(nèi)進(jìn)行的 定義:糖類、脂肪、蛋白質(zhì)等有機(jī)物質(zhì)在細(xì)胞中進(jìn)行氧化分解生成CO2和H2O并釋放出能量的過程稱為生物氧化(biological oxidation)。又稱為組織氧化或細(xì)胞氧化、組織呼吸或細(xì)胞呼吸。 特點(diǎn):生物氧化是在活細(xì)胞內(nèi)進(jìn)行的: 1)、生物氧化反應(yīng)條件溫和(體溫、接近中性的
22、pH和有水環(huán)境中) ; 2)、氧化反應(yīng)分階段進(jìn)行,能量逐步釋放; 3)、生物氧化過程中釋放的化學(xué)能通常被偶聯(lián)的磷酸化反應(yīng)所利用,貯存于高能磷酸化合物(如ATP)中,當(dāng)生命活動需要時(shí)再釋放出來; 4)、 真核細(xì)胞在線粒體內(nèi)進(jìn)行,原核細(xì)胞在細(xì)胞膜上進(jìn)行。 二、 CO2與H2O的生成 1、CO2的生成:方式:糖、脂、蛋白質(zhì)等有機(jī)物轉(zhuǎn)變成含羧基的中間化合物,然后在酶催化下脫羧生成CO2。 類型: 直接脫羧和氧化脫羧 2、H2O的生成:代謝物在脫氫酶催化下脫下的氫由相應(yīng)的氫載體(NAD+、FAD)所接受,再通過一系列遞氫體或遞電子體傳遞給氧而生成H2O 。 三、線粒體電子傳遞體系:
23、 1、電子傳遞鏈的概念,電子傳遞鏈的組成: NADH呼吸鏈(最廣)和FADH2呼吸鏈(要求能寫出兩條鏈,注意順序); NADH呼吸鏈:由復(fù)合體Ⅰ、Ⅲ、Ⅳ及CoQ、Cytc組成 FADH2呼吸鏈:由復(fù)合體Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ及CoQ、Cytc組成 復(fù)合體Ⅰ:NADH-CoQ還原酶:輔基:FMN,鐵硫蛋白(Fe-S) 復(fù)合體Ⅱ:琥珀酸- CoQ還原酶:輔基組成:Cytb、Fe-S、Cytc1 復(fù)合體Ⅲ: CoQ -細(xì)胞色素C還原酶; 組成:Cytb、Fe-S、Cytc1 復(fù)合體Ⅳ:細(xì)胞色素氧化酶-末端氧化酶;組成:Cyta、Cyta3、Cu 2、電子傳遞抑制劑:如氰化物、CO 四
24、生物氧化中能量的產(chǎn)生——氧化磷酸化 1、ATP的作用; 2、ATP的生成方式:底物水平磷酸化的概念、氧化磷酸化的概念;化磷酸化的指標(biāo)—磷氧比( P/O )的概念; 底物水平磷酸化 通過底物氧化形成的高能磷酸化合物直接將磷酸基團(tuán)轉(zhuǎn)移給ADP偶聯(lián)生成ATP的反應(yīng),這種ATP生成的方式稱為底物水平磷酸化。 2、氧化磷酸化 代謝物脫下的氫經(jīng)呼吸鏈傳遞給氧生成水的過程中釋放出的自由能用于合成ATP(即ADP+Pi→ATP),這種呼吸鏈氧化反應(yīng)放能和ATP生成(磷酸化)相偶聯(lián)的過程稱氧化磷酸化。氧化磷酸化是在線粒體內(nèi)進(jìn)行的。 代謝物脫下的氫經(jīng)呼吸鏈傳遞給氧生成水的過程中釋放出的自由能用于合成
25、ATP(即ADP+Pi→ATP),這種呼吸鏈氧化反應(yīng)放能和ATP生成(磷酸化)相偶聯(lián)的過程稱氧化磷酸化。氧化磷酸化是在線粒體內(nèi)進(jìn)行的。 3、氧化磷酸化的生理生化意義 使脫氫酶的輔酶NAD+再生 釋放能量推動生命活動 3、氧化磷酸化的偶聯(lián)機(jī)理:化學(xué)滲透假 五、 線粒體外NADH的氧化磷酸化作用 1、磷酸甘油穿梭系統(tǒng)(肌細(xì)胞): 2、蘋果酸穿梭系統(tǒng)(肝細(xì)胞 第五章 糖類代 一、 糖在動物體內(nèi)的一般概述 二 、糖的分解供能 (一)、糖酵解(無氧氧化):歷程(包括結(jié)構(gòu)式)、特點(diǎn)、關(guān)鍵的限速酶、反應(yīng)的部位、生理意義、凈產(chǎn)生ATP數(shù)。 (一)、糖酵解 指葡萄糖在無氧條件下分解生成
26、乳酸并釋放出能量的過程。該途徑也稱作Embden-Meyethof-Parnas途徑,簡稱EMP途徑。 反應(yīng)場所: 胞液 (cytoplasm) 代謝終產(chǎn)物:乳酸 (lactate) 四個(gè)階段: 活化 裂解 放能 還原 ( 1 )、葡萄糖的磷酸化 己糖激酶是糖酵解途徑的第一個(gè)限速酶。激酶:從ATP轉(zhuǎn)移磷酸基團(tuán)到受體上的酶。此類酶都需要Mg2+作為激活因子。 ( 2 )、磷酸己糖異構(gòu)化 ( 3 )、 1,6- 二磷酸果糖的生成 磷酸果糖激酶是糖酵解途徑的最重要的限速酶 ( 4 )、 1,6- 二磷酸果糖的裂解 ( 5 )、磷酸丙糖的同分異構(gòu)化 相當(dāng)于 1,6- 二磷酸
27、果糖裂解為兩分子的 3- 磷酸甘油醛。 ( 6 )、 3-磷酸甘油醛氧化為 1,3- 二磷酸甘油酸 這是糖酵解過程中唯一一步脫氫反應(yīng) ( 7 )、高能磷酸基團(tuán)的轉(zhuǎn)移 糖酵解中第一次底物水平磷酸化,1分子葡萄糖產(chǎn)生2分子ATP (8 )、 3-磷酸甘油酸異構(gòu)為 2- 磷酸甘油酸 ( 9 )、磷酸烯醇式丙酮酸的生成 ( 10 )、丙酮酸的生成 糖酵解中第二次底物水平磷酸化,丙酮酸激酶是第 第三個(gè)限速酶,1分子葡萄糖產(chǎn)生2分子ATP。 ( 11 )、自發(fā)反應(yīng) 2、酵解反應(yīng)的特點(diǎn): l 全部反應(yīng)過程無氧參與。 l 糖酵解代謝途徑可將一分子葡萄糖分解為兩分子乳酸,凈生成兩分
28、子 ATP 。 l 糖酵解代謝途徑有三個(gè)關(guān)鍵酶,即己糖激酶(葡萄糖激酶)、磷酸果糖激酶、丙酮酸激酶。 4、糖酵解的生理意義 1. 在無氧和缺氧條件下,作為糖分解供能的補(bǔ)充途徑。 2. 在有氧條件下,作為某些組織細(xì)胞(如成熟的紅細(xì)胞)主要的供能途徑。 葡萄糖磷酸化反應(yīng)的意義 ? 將葡萄糖磷酸化成易參加代謝反應(yīng)的活化形式; ? 磷酸化的葡萄糖有防止胞內(nèi)葡萄糖外滲的作用; ? 為后續(xù)進(jìn)行的底物水平磷酸化貯備了磷酸基團(tuán)。 3、酵解途徑的調(diào)控部位 調(diào)控部位 調(diào)控性質(zhì)及特點(diǎn) 變構(gòu)激活劑 變構(gòu)抑制劑 注 己糖激酶 變構(gòu)調(diào)節(jié) 葡萄糖 6-P-F 植物細(xì)胞中主要位
29、點(diǎn) 磷酸果糖激酶 變構(gòu)調(diào)節(jié)(關(guān)鍵酶,為主要控制部位) ADP、AMP ATP、檸檬酸,NADH,脂肪酸 ? 丙酮酸激酶 變構(gòu)調(diào)節(jié) 1,6-二磷酸果糖 ATP,NADH,Ala,脂肪酸 植物細(xì)胞主要調(diào)節(jié)位點(diǎn) 3-磷酸甘油醛脫氫酶 變構(gòu)調(diào)節(jié) NAD+ ? ? (二)、糖的有氧氧化:歷程、特點(diǎn)、關(guān)鍵的限速酶、反應(yīng)的部位、丙酮酸脫氫酶系組成、 TCA的生理意義、凈產(chǎn)生ATP數(shù)。 l 絕大多數(shù)組織細(xì)胞通過糖的有氧氧化途徑獲得能量。此代謝過程在細(xì)胞胞液和線粒體(cytoplasm and mitochondrion)內(nèi)進(jìn)行。 糖的有氧氧化代謝途徑可分為:葡萄糖酵解、丙酮
30、酸氧化脫羧和三羧酸循環(huán)三個(gè)階段。 丙酮酸進(jìn)入線粒體(mitochondrion),在丙酮酸脫氫酶系(pyruvate dehydrogenase complex)的催化下氧化脫羧生成乙酰CoA(acetyl CoA)。 丙酮酸脫氫酶系 (多酶復(fù)合體、位于線粒體內(nèi)膜) 三種酶單體: 丙酮酸脫羧酶( E1 ); 硫辛酸乙酰基轉(zhuǎn)移酶( E2 ), 二氫硫辛酸脫氫酶( E3 )。 六種輔助因子: TPP ,硫辛酸, NAD+,F(xiàn)AD, HSCoA 和 Mg2+ 1.3 三羧酸循環(huán) 三羧酸循環(huán)(檸檬酸循環(huán)或 Krebs 循
31、環(huán)或 TCA 循環(huán))是指在線粒體中,乙酰 CoA 首先與草酰乙酸縮合生成三個(gè)羧基的檸檬酸,然后經(jīng)過一系列的代謝反應(yīng),乙?;谎趸纸猓蒗R宜嵩偕难h(huán)反應(yīng)過程。 反應(yīng)部位:線粒體基質(zhì) 一)縮 合 反 應(yīng) 檸檬酸合成酶是三羧酸循環(huán)的第一個(gè)限速酶 (二)檸檬酸異構(gòu)化為異檸檬酸 (三)異檸檬酸生成α-酮戊二酸 這是三羧酸循環(huán)的第一次氧化脫羧反應(yīng),異檸檬酸脫氫酶是第二個(gè)限速酶。 (四 )α-酮戊二酸氧化脫羧反應(yīng) 這是三羧酸循環(huán)的第二次氧化脫羧 反應(yīng), α-酮戊二酸脫氫酶復(fù)合體是第三個(gè)限速酶。TCA循環(huán)中唯一的一步不可逆反應(yīng),使得整個(gè)循環(huán)不可逆。 α-酮戊二酸脫
32、氫酶復(fù)合體包括: 1、α-酮戊二酸脫氫酶E1 2、琥珀酰轉(zhuǎn)移酶E2 3、二氫硫辛酸脫氫酶E3 4、六個(gè)輔助因子 五)琥珀酸的生成 這是三羧酸循環(huán)的唯一一次底物水平磷酸化。 (六)延胡索酸的生成 (七)蘋果酸的生成 八)草酰乙酸的再生 TCA 第一階段:檸檬酸生成 TCA 第二階段:氧化脫羧 TCA 第三階段:草酰乙酸再生 三羧循環(huán)的化學(xué)反應(yīng)式和能量計(jì)量 a、總反應(yīng)式: CH3COSCoA+3NAD++FAD+GDP+Pi+3H2OT
33、 2CO2+CoASH+3NADH+3H+ +FADH2+GTP b、三羧酸循環(huán)的能量計(jì)量 能量“現(xiàn)金” : 1 GTP ---------------------1ATP 能量“支票”: 3 NADH-------兌換率 1:3----------9ATP 12ATP 1 FADH2-----兌換率 1:2------2ATP 三羧酸循環(huán)的特點(diǎn): (1)循環(huán)反應(yīng)在線粒體中進(jìn)行,為不可逆反應(yīng)。 (2)每完成一次循環(huán),氧化分解掉一分子乙酰CoA,可生成12分子ATP。
34、 (3)循環(huán)中的各酸既不能通過此循環(huán)反應(yīng)生成,也不被此循環(huán)反應(yīng)所消耗。但是各酸在有機(jī)體中不斷參與其它物質(zhì)的形成。 (4)三羧酸循環(huán)中兩次脫羧反應(yīng),生成兩分子CO2。 循環(huán)中有四次脫氫反應(yīng),生成三分子NADH和一分子FADH2 (5)循環(huán)中有一次底物水平磷酸化,生成一分子GTP。 (6)三羧酸循環(huán)的關(guān)鍵酶是檸檬酸合酶、異檸檬酸脫氫酶和α-酮戊二酸脫氫酶系。 3、(三)磷酸戊糖途徑:特點(diǎn)及意義 反應(yīng)部位:胞液 三、葡萄糖異生作用:概念;代謝路徑;三步不可逆步驟(包括結(jié)構(gòu)式);糖異生作用的生理意義;乳酸循環(huán)( Cori 循環(huán));底物循環(huán)的概念。 l 由非糖物質(zhì)轉(zhuǎn)變?yōu)槠咸烟腔蛱窃倪^
35、程稱為糖異生 (gluconeogenesis) 。 l 糖異生代謝途徑主要存在于肝及腎中 (肌肉-肝臟-肌肉),稱乳酸循環(huán) 4、底物循環(huán) 在糖異生反應(yīng)中,象 6- 磷酸果糖磷酸化為 1 , 6-二磷酸果糖和后者又被水解為 6- 磷酸果糖這樣一對由不同酶催化的正逆反應(yīng)稱為底物循環(huán).在正常情況下正逆反應(yīng)不會同時(shí)活躍,如果正逆反應(yīng)以同樣速度進(jìn)行,將會造成 ATP 無效循環(huán),使體溫升高。 第六章 脂類代謝 1、脂肪的分解代謝 C、脂肪酸的分解代謝:活化(胞液、消耗兩個(gè)高能鍵 )、轉(zhuǎn)運(yùn)的載體-肉堿、β-氧化作用的概念及特點(diǎn)、 β-氧化四個(gè)連續(xù)過程:脫氫、加水、再脫氫、硫解; β-氧化
36、進(jìn)行的亞細(xì)胞部位(線粒體)、產(chǎn)能的計(jì)算。 D、酮體的概念、肝內(nèi)線粒體生酮肝外用(肝內(nèi)缺乏琥珀酰COA轉(zhuǎn)移酶)、酮體的生理意義。 2、脂肪的合成代謝 A、長鏈脂肪酸的合成:合成部位;原料:乙酰輔酶A(非反芻動物來自葡萄糖(存在線粒體)、NADPH;檸檬酸-丙酮酸循環(huán)轉(zhuǎn)運(yùn);延長加入二碳的形式:活化形式(丙二酸單酰CoA );脂肪酸合成酶系、ACP-脂?;d體蛋白(同CoA )、脂肪酸合成的特點(diǎn)。 B、脂肪的合成代謝:甘油二酯途徑(主要途徑);甘油一酯途徑 第七章 含氮小分子代謝 一、蛋白質(zhì)的營養(yǎng)作用:氮平衡、蛋白質(zhì)的生理價(jià)值 、決定蛋白質(zhì)價(jià)值的影響因素:必需氨基酸的含量、種類及比例
37、氮平衡:體內(nèi)蛋白質(zhì)的合成與分解處于動態(tài)平衡中,故每日氮的攝入量與排出量也維持著動態(tài)平衡,這種動態(tài)平衡就稱為氮平衡 必需氨基酸:約有10種,包括賴氨酸、蛋氨酸、色氨酸、苯丙氨酸、亮氨酸、異亮氨酸、纈氨酸、蘇氨酸、組氨酸和精氨酸。對雛雞還有甘氨酸。 二、氨基酸的一般分解代謝 1、脫氨基方式: (1)、氧化脫氨基作用(需NAD+或NADP+作輔酶):氧化脫氨基作用 L-型氨基酸氧化酶以FMN為輔酶,催化L-氨基酸脫氨基作用,脫下的氫原子交給O2,生成H2O2,但在體內(nèi)分布不廣,活性不強(qiáng)。 D-型氨基酸氧化酶以FAD為輔酶,催化D-氨基酸脫氨基作用,脫下的氫原子交給O2,生成H2O2,在體內(nèi)
38、分布廣,活性強(qiáng)。 (2)、轉(zhuǎn)氨基作用:轉(zhuǎn)氨酶(輔酶:磷酸吡哆醛),過程可逆谷丙轉(zhuǎn)氨酶(GPT)、谷草轉(zhuǎn)氨酶(GOT (3)、聯(lián)合脫氨基作用(主要方式)a、轉(zhuǎn)氨酶與L-谷氨酸脫氫酶作用相偶 b、轉(zhuǎn)氨基作用與嘌呤核苷酸循環(huán)相偶聯(lián)(骨骼肌、心肌) 2、氨基酸的脫羧基作用:脫羧酶的輔酶為VB6,即磷酸吡哆醛 2、鳥氨酸循環(huán)與尿素的合成 體內(nèi)氨的主要代謝去路是用于合成無毒的尿素(哺乳動物)。 合成尿素的主要器官是肝臟,但在腎及腦中也可少量合成。 尿素合成是經(jīng)稱為鳥氨酸循環(huán)的反應(yīng)過程來完成的。催化這些反應(yīng)的酶存在于胞液和線粒體中。 合成的特點(diǎn): (1)合成主要在
39、肝臟的線粒體和胞液中進(jìn)行; (2)是一個(gè)耗能過程,每生成一分子的尿素需消耗3分子的ATP,4個(gè)高能磷 酸鍵; (3)精氨酸代琥珀酸合成酶是尿素合成的關(guān)鍵酶; (4)消除2分子氨基和1分子的CO2。 兩個(gè)氨基分別來自游離氨和Asp,一個(gè)CO2來自TCA循環(huán) 。 (5)延胡索酸將尿素循環(huán)和三羧酸循環(huán)聯(lián)系起來了。 生糖氨基酸、生酮氨基酸、生糖兼生酮氨基酸。 A、生糖氨基酸:在體內(nèi)可以轉(zhuǎn)變成糖的氨基酸,即這類氨基酸脫氨基后生成 的α-酮酸可以轉(zhuǎn)變?yōu)楸峄蛉人嵫h(huán)中的各種中間產(chǎn)物,這些物質(zhì)又可進(jìn)一步異生成糖。 B、生酮氨基酸:能轉(zhuǎn)化成酮體的氨基酸,即與之相對應(yīng)的α-
40、酮酸可以轉(zhuǎn)變?yōu)橐阴oA或乙酰乙酰CoA進(jìn)一步轉(zhuǎn)變成酮體。( Leu,Lys ) C、生糖兼生酮氨基酸 第八章 核酸的化學(xué)結(jié)構(gòu) 一 、核酸的化學(xué)組成與結(jié)構(gòu):元素的組成特點(diǎn)、5種堿基的結(jié)構(gòu)比較、核糖與脫氧核糖結(jié)構(gòu)的比較、 二、DNA的分子結(jié)構(gòu): DNA的堿基組成特點(diǎn)、 DNA 的一級結(jié)構(gòu)(連接鍵、5‘-3’)、 DNA一級結(jié)構(gòu)與蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)的比較、 DNA的二級結(jié)構(gòu)-雙螺旋模型特征、主要維持力-堿基堆集力、雙螺旋結(jié)構(gòu)的意義。 DNA一級結(jié)構(gòu)與蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)的比較 ? 比較項(xiàng)目 蛋白質(zhì) 核酸 基本結(jié)構(gòu)單位 20種氨基酸 4種相應(yīng)的單核苷酸 連接的鍵 肽鍵 3’,5‘
41、-磷酸二酯鍵 鏈端 多肽鏈,具C端和N端 多核苷酸鏈,具5’和3‘端 主鏈的組成 (不變成分) 由氨基N、а-C、羧基C原子反復(fù)循環(huán)組成,即-N-C а-C- 由戊糖+磷酸反復(fù)組成 側(cè)鏈 (可變成分) 20種氨基酸殘基的R基的不同排列組合 4種堿基的不同排列組合 DNA的一些性質(zhì) (一)溶解性 DNA微溶于,水呈酸性,加堿促進(jìn)溶解,不溶于有機(jī)溶劑。 (二)黏稠性 DNA分子很長,形成溶液后呈現(xiàn)黏稠狀。 (三)易脆性 僵直具有剛性 (四) 穩(wěn)定狀態(tài) 抽干水分狀態(tài)穩(wěn)定 (五)兩性電解質(zhì) (六)DNA紫外吸收 (2
42、60nm)核酸組成中的嘌呤、嘧啶堿都具有共軛雙鍵,因此對紫外光有強(qiáng)烈的吸收。 三、DNA的三級結(jié)構(gòu):正超螺旋、負(fù)超螺 四、DNA的一些性質(zhì): DNA紫外吸收(260nm)、變性、增色效應(yīng)、復(fù)性、減色效應(yīng)、雜交、影響Tm值的因素 五、 RNA的分子結(jié)構(gòu): RNA的一級結(jié)構(gòu)、 tRNA的二級結(jié)構(gòu)特征-三葉草 第九章 核酸的生物學(xué)功能 一、遺傳信息傳遞的中心法則:內(nèi)容及意義 內(nèi)容:DNA通過復(fù)制將遺傳信息由親代傳遞給子代;通過轉(zhuǎn)錄和翻譯,將遺傳信息傳遞給蛋白質(zhì)分子,從而決定生物的表現(xiàn)型。DNA的復(fù)制、轉(zhuǎn)錄和翻譯過程就構(gòu)成了遺傳學(xué)的中心法則。 在RNA病毒中,其遺傳信息貯存在RNA分子中
43、。因此,在這些生物體中,遺傳信息的流向是RNA通過復(fù)制,將遺傳信息由親代傳遞給子代,通過反轉(zhuǎn)錄將遺傳信息傳遞給DNA,再由DNA通過轉(zhuǎn)錄和翻譯傳遞給蛋白質(zhì)。這樣補(bǔ)充了遺傳的中心法則. l 意義 :中心法則總結(jié)了生物體內(nèi)遺傳信息的流動規(guī)律,揭示遺傳的分子基礎(chǔ),不僅使人們對細(xì)胞的生長、發(fā)育、遺傳、變異等生命現(xiàn)象有了更深刻的認(rèn)識,而且以這方面的理論和技術(shù)為基礎(chǔ)發(fā)展了基因工程,給人類的生產(chǎn)和生活帶來了深刻的革命。 二、DNA 的生物合成:半保留復(fù)制、半不連續(xù)過程、前導(dǎo)鏈、隨從鏈、剛崎片段、需要RNA引物(前導(dǎo)鏈只需一個(gè)引物,而后滯鏈則需多個(gè)引物 )、從5‘—3’方向進(jìn)行、 DNA的復(fù)制相關(guān)的酶和
44、蛋白質(zhì)、如何保證復(fù)制的精確性。 三、 DNA的損傷與修復(fù):幾種修復(fù)的方式:光修復(fù)、切除修復(fù)、重組修復(fù)、 SOS修復(fù)。 四、RNA指導(dǎo)下的DNA合成(反向轉(zhuǎn)錄):概念、逆轉(zhuǎn)錄酶的功能 五、轉(zhuǎn)錄:轉(zhuǎn)錄的方式-不對稱轉(zhuǎn)錄、大腸桿菌RNA聚合酶的特點(diǎn)、核心酶與s的作用、 啟動子、從5‘—3’方向進(jìn)行、轉(zhuǎn)錄終止的方式。 DNA和RNA合成的比較 六、蛋白質(zhì)的生物合成:遺傳密碼如何編碼及遺傳密碼的主要特征、起始密碼子-AUG、終止密碼子-UAA、UAG、UGA。同義密碼子、擺動學(xué)說、核糖體的A位點(diǎn)、P位點(diǎn)。原核與真核起始氨基酸的差異。 在RNA聚合酶的催化下,以一段DNA鏈為模板合成RNA,
45、從而將DNA所攜帶的遺傳信息傳遞給RNA的過程稱為轉(zhuǎn)錄(transcription)。 經(jīng)轉(zhuǎn)錄生成的RNA有多種,主要的是rRNA,tRNA,mRNA。 不對稱轉(zhuǎn)錄:只有一條DNA鏈參與了轉(zhuǎn)錄 DNA和RNA合成的比較 ? DNA的合成(復(fù)制) RNA的合成(轉(zhuǎn)錄) 合成部位 主要在細(xì)胞核中,也在葉綠體、線粒體中 核仁:rRNA 核質(zhì):mRNA 、tRNA 線粒體、葉綠體也進(jìn)行 底物 dNTP (4種) dATP、 dGTP 、dCTP、 dTTP NTP (4種) ATP、 GTP、 CTP、 TTP 模板 DNA的兩條鏈 DNA中的任一條鏈 酶系 多種酶及蛋白因子(見前) DNA指導(dǎo)下的RNA聚合酶 引物 要RNA作引物 不要引物 作用機(jī)理 引物或正延長的DNA的3‘-OH向新加入的dNTP的5’-磷酸進(jìn)行親核進(jìn)攻。 正延長的RNA的3‘-OH向新加入的NTP的5’-磷酸進(jìn)行親核進(jìn)攻。 鏈的延長方向 5‘-3’合成,3‘-OH端延長 5‘-3’合成,3‘-OH端延長 合成方式 半保留復(fù)制 全保留轉(zhuǎn)錄 產(chǎn)物 雙鏈DNA 單鏈RNA 13
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