《利用CRISPCAS9技術改良水稻YN6的香味品質分析研究生物技術專業(yè)》由會員分享，可在線閱讀，更多相關《利用CRISPCAS9技術改良水稻YN6的香味品質分析研究生物技術專業(yè)（22頁珍藏版）》請在裝配圖網上搜索。

1、論文題目： 利用CRISP/CAS9技術改良水稻YN6的香味品質 摘要 稻米的香味品質是稻米品質的重要內容之一。對稻米品種的香味品質改良，有利于增加其市場經濟價值。研究表明，稻米的香味性狀主要由水稻第8染色體上的甜菜堿醛脫氫酶（Betaine Aldehyde Dehydrogenase，OSBadh2）控制。該基因失活使芳香物質2-乙?；?1-吡咯啉（2-acetyl-1-pyrroline，2AP）在稻米中大量積累，產生香味。 本次實驗使用了最近幾年新興的定點基因敲除技術CRISP/CAS9，本實驗通過基因敲除技術來對北方粳稻品系YN6進行改良，通過敲除YN6水稻基因組中OSB

2、adh2基因，改良基因香味品質。具體操作結果如下： 1 實驗過程中實現了對具有定點敲除功能的CRISP/CAS9載體的構建； 2轉化CRISP/CAS9載體，獲得了1000個獨立抗性愈傷，從中分化出732個獨立的轉基因植株。 3 通過對CRISP/CAS9修飾的OSBadh2目標位點處的序列進行測序分析，從中獲得了兩株發(fā)生了基因編輯。目標基因經修飾后產生了移碼突變，經加代純合后，產生了香味表型。 關鍵詞 香味基因；CRISP/CAS9；定點突變技術；轉基因 Abstract Fragrance is one of the most sign

3、ificant rice qualities. Improvement of rice fragrance quality will undoubtedly enlarge rice marketing value. Rice fragrance was suggested to be controlled by a betaine aldehyde dehydrogenase (OsBadh2) gene，which is located in rice chromosome 8. The disfunction of this gene will lead to massive produ

4、ction of an aromatic compound 2-acetyl-1-pyrroline (2AP) in rice，which consequently generate rice fragrance phenotype. This study applied a recently developed gene-editing technology，which is mediated by a transcription activator-like effector nuclease (CRISP/CAS9）and is，in result，capable of modify

5、ing the target gene. Through CRISP/CAS9 technology，we successfully disenable the OsBadh2 gene in an elite japonica variety YN6，strongly adding the material the rice fragrance. The main results were concluded as follows: 1.A functional CRISP/CAS9 vectors was established. 2.Through transformation of

6、 CRISP/CAS9 via Agrobacterium mediated genetic transformation，we obtained 1000 independent hygromacin-resistant calli，and among them，732 independent transgenic plants were differentiated. 3.Through analysis by sequencing the CRISP/CAS9 aimed site in the target gene OsBadh2，we identified 2 plants，i

7、n which several bases were occurred deletion，leading to gene frame shift mutation. The homologous lines were able to produce readily perceivable fragrance. Key words Fragrance gene; CRISP/CAS9;gene editing technology; genetically modified III 目錄 摘要 I Abstract II 1. 前言 1 1.

8、1香稻米的定義及我過香稻米的現狀 1 1.2 水稻香味的研究進展 1 1.2.1 水稻香味的形成機制 1 1.2.2香味的鑒定方法 2 1.3 CRISP/CAS9技術原理 2 1.4實驗目的及意義 3 2. 材料與方法 4 2.1材料 4 2.1.1材料 4 2.1.2轉化相關試劑 5 2.1.3 PCR鑒定分析所用試劑 5 2.1.4試驗引物 6 2.2試驗相關儀器 6 2.3方法 7 2.3.1水稻轉化體系建立與再生轉基因苗的建立 7 2.3.2轉基因苗子鑒定分析 8 2.3.3水稻香味的鑒定方法 9 3. 結果與分析 9 3.1 YN6香味基因的序列

9、分析 9 3.2載體的構建及分析 9 4. 討論 11 4.1選擇CRISP/CAS技術構建載體 11 4.2基因定點編輯技術 12 4.3實驗展望 13 結論 14 參考文獻 15 致謝 17 1. 前言 水稻是世界上許多國家重要的糧食作物。隨著人們經濟生活的水平的提高，稻米的食用口感越來越受到關注。香米在國內外市場上倍受消費者的追捧，具有非常良好的市場效益，這使對水稻香味的研究有了重大意義，包括對控制香味的基因，遺傳特性和香味的鑒別。 1.1香稻米的定義及我過香稻米的現狀 我國是稻作歷史最悠久、水稻遺傳資源最豐富的國家之一，浙江河姆渡、湖南羅家角

10、、河南賈湖出土的炭化稻谷證實，中國的稻作栽培至少已有7000年以上的歷史。我國科學家在矮化育種、雜種優(yōu)勢利用的雜交水稻、超級稻育種、水稻生物技術研究等方面，均走在世界的前列[1]。 根據中華人民共和國農業(yè)部行業(yè)標準 ( 香稻NY / T596-2002)，對香稻米的定義是:自身含有香味物質，其香味強度超過人對香味的識別閾，在蒸煮或生熟品嘗過程中，能夠逸出或散發(fā)令人敏感香味的稻米。世界上各水稻生產國均有香稻種植，其普遍分布在東南亞和南亞地區(qū)，主要在印度、巴基斯坦、中國臺灣、孟加拉國、阿富汗、伊朗、中國和美國等地。國際市場上著名的香米品種主要有巴基斯坦的Basmati種群、泰國 Khao Daw

11、k Mai1105、Jasmine、RD6、Siamati等。中國的香稻資源也很豐富，如陜西的洋縣香米、湖南的江永香米、山東的曲阜香米、福建的過山香米等[2]。 1.2 水稻香味的研究進展 1.2.1 水稻香味的形成機制 許多研究人員對香米的成分進行分析，被檢測出來且具有揮發(fā)性的物質有上百種，但是經過眾多學者的研究，控制香米香味的主要物質是2-乙酰-1-吡咯啉（2-acetyl-1-pyrrolin，2AP）[3]。但是對于香米香味的遺傳方式，各個研究人員產生了分歧[4]。對于香味遺傳所產生的分歧，主要是因為對香味不能進行一個定量的分析，各個研究人員的對香味的評判方式并不一致，而且對香味

12、定量也有一定的難度。盡管有這些分歧，研究者們還是得到了一個被眾人認可的結論，即水稻香味是受隱性單基因遺傳控制[5]。 1.2.2香味的鑒定方法 對于香味的鑒定，有五種方法。熱水法是將研磨后的稻粒放入試管中加熱，通過嗅其產生的味道來鑒別是否有香味。但這種方法存在風險，有可能會因為其他物質的揮發(fā)產生干擾。故目前大多數研究者很少使用這種方法。咀嚼法是一個常用的香味鑒別方法。即通過咀嚼稻米粒直觀的鑒別是否產生了香味[6]。蒸煮法是將水稻煮熟成為米飯，來鑒別香味是否產生。氫氧化鉀浸泡法實驗室中較為常用，其鑒別結果比較準確，不易被其他物質干擾，其原理是因為KOH可以與香稻的香味產生物質2-乙酰-1-吡

13、咯啉特異性結合，且不能與稻米里其他物質反應。以上四種方法事項未鑒定的定性檢測方法。其中KOH浸泡法最為實用，結果也很準確。另外三種方法比較簡便，但不夠準確。因為每個人的味覺嗅覺有差異。會使實驗結果不準確。第五種方法是一種較為準確的定量分析法，氣-質聯(lián)用(GC-MS)法有很多的有點，其結果準確，是目前鑒別香味的最準確的方法之一。主要的方法是先將稻米研碎，用溶液溶解。再用蒸餾法將提取出的稻米主要物質蒸餾，使主要物質變成氣體，再將氣體注入氣相色譜儀進行分析，最后再用質譜法定性牌[7]。 1.3 CRISP/CAS9技術原理 基因組編輯技術是一種新興的一種對基因組進行準確修飾的技術，它能在基因組上

14、進行定點突變、插入或刪除、基因置換、在兩位點或多位點同時定點突變或小片段缺失等操作，已經成為目前發(fā)育生物學中的重要工具[8]。該技術可以用于系統(tǒng)地研究基因、調控元件在特定生理或發(fā)育過程中所起到的作用，或者用于作物性狀的定向改良[9]。 CRISPR/CAS 系統(tǒng)的結構非常簡單，是CRISPR位點附近4~10個編碼CAS蛋白的基因連接組成[10]。CRISPR位點由同向保守重復序列(directed repeats)、間隔序列(spacers)和5’端的前導序列(leader sequence)排列組成[11]。其中，間隔序列來源于外源基因片段即原間隔序列(protospacers)，重復序列

15、與間隔序列排列，可以擁有2~100個重復[12]。 CRISPR序列基因被轉錄為pre- crRNA(precursor CRISPR RNA)，然后被剪切為較短的CRISPR RNAs (crRNAs)，指導Cas蛋白的識別與降解[13]。Cas基因則主要編碼切割、修飾核酸相關的蛋白[14]。在進行基因組編輯時，CRISPR/Cas9系統(tǒng)主要起兩個作用[15]：一是與RNA相結合，這個作用在識別序列的過程中起決定性作用；另一個是間隔序列(protospacer adjacent motif，PAM)也參與識別靶序列[16]。PAM序列是有物種特異性的，不同細菌中序列不同[17]。目前在基因組

16、編輯中，應用最廣泛的是Streptococcus pyogenes Cas9 (SpCas9)，它的PAM序列是5'-NGG-3'[18]。 自 CRISPR/Cas9 系統(tǒng)被開發(fā)為基因組編輯工具后，很快就成功應用于各種動物和微生物等多個物種中[19]。但直到2013年，中國科學院遺傳與發(fā)育生物學研究所高彩霞實驗室才首次將該技術應用到水稻、小麥中，證明了CRISPR/Cas9系統(tǒng)能夠應用于植物基因組編輯中[20]。 1.4實驗目的及意義 本研究所用水稻材料為北方優(yōu)良粳稻品系YN6。YN6米粒與北方其它普通粳稻相比，抗冷與抗病性強、生育期短但結實率好，粒長且米飯口感好。與黑龍江省的優(yōu)質香米

17、稻花香2號相比，YN6不易倒伏，適種性廣， 但不具有香味。本研究利用CRISP/CAS9基因定點編輯技術，定向敲除失活YN6的OsBadh2基因，使YN6產生香味表型。 香稻是一種各個器官均能散發(fā)香味的特殊水稻品種，香稻的營養(yǎng)物質含量很高，含有大量的氨基酸和蛋白質，受到了各國人民的追捧。香稻具有良好的口干，清新的香味，豐富的營養(yǎng)價值，是各種水稻中的珍品，其歷史大約已有2000年[21]。眾所周知，中國是世界第一水稻生產和消費大國，擁有豐富多樣香稻品種，但出口型優(yōu)質香稻品種廖廖無幾，占領國際香米市場一席之地的中國香米幾乎為零，搶占國際香米交易市場的主要是印度Basmati香 米品系、泰國KDM

18、L105、中國臺灣Jasmine。加強中國香稻育種研究工作，提升中國香米生產水平和出口競爭水平，是當前中國稻作科研的迫切任務[22]。 2. 材料與方法 2.1材料 2.1.1材料 本研究所用水稻材料為黑龍江省粳稻品種YN6。YN6米粒與北方其它普通粳稻相比，抗冷與抗病性強、生育期短但結實率好，粒長（如圖2-1）且米飯口感好。與黑龍江省的優(yōu)質香米稻花香2號相比，YN6不易倒伏，適種性廣， 但不具有香味。 稻花香2號 YN6 圖2-1 稻花香與YN6生育期與粒型比較 Figure 2-1 The comparisons of two

19、 traits between Daohuaxiang and YN6 2.1.2轉化相關試劑 農桿菌EHA105菌種，由本實驗室提供。 實驗中所用的誘導、繼代、選擇、分化和生根培養(yǎng)基的組成，見表3-1 表3-1水稻再生及轉化體系用到的培養(yǎng)基 Table 2-1 The medium of rice regeneration and transformation system 2.1.3 PCR鑒定分析所用試劑 CTAB 緩沖液、TE 緩沖液、氯仿/異戊醇（V:V=24:1），70%乙醇，無水乙醇，異丙醇、RNA 酶、蒸餾水、液氮、5×TBE 母液、10×TBE 母液、10％

20、過硫酸胺 (APS)、6%聚丙烯酰胺膠儲存液、Loading Buffer 溶液、2%剝離硅烷、0.5%親和硅烷、固定液（冰醋酸 100mL 加蒸餾水至 1000mL）、銀染液（1 gAgNO3+1.5 mL 37%甲醛+1 LH2O）；顯影液（1L 30g/L Na2CO3+1.5 mL 37%甲醛+200μL 10 mg/ml 硫代硫酸鈉）。 2.1.4試驗引物 由于利用CRISPR/CAS9技術敲除水稻OsBadh2基因，當載體導入細胞體內所結合的位點有多個。為了防止誤差，我們需對位點進行檢測，鑒定CRISPR/CAS9鑒定體中的T-DNA轉移整合到待改良水稻品系YN6中。此處我們利

21、用聚合酶鏈式反應 (PCR)方法進行鑒定，所用引物為Ubiq1/Ubiq2。第二步對轉基因的編輯作用位點進行PCR鑒定分析和測序分析，所用引物為TALfr F/TALfr R。引物均由上海生工有限公司合成，具體序列參見表2-1。 表2-1 用于篩選和鑒定轉基因和基因編輯事件的引物序列 Table 2-1 The primer sequences for screening and identification of the transgenic and gene-editing events. 引物名稱 引物序列(5′→3′) TALfr F TALfr R Ubiq1 Ubi

22、q2 5′-ACACAGCAATCTTTCCTGAAC-3′ 5′-TGAAATACCAAGGTGTGATC-3′ 5′- GTAACCTCGGATTCAGC-3′ 5′-GTCAATCTAGCCTAATCTGTC-3′ 2.2試驗相關儀器 實驗中所使用的儀器和設備均由黑龍江大學生命科學學院提供如表2-2。 表2-2 實驗所用儀器 Table 2-2 Laboratory instruments 2.3方法 2.3.1水稻轉化體系建立與再生轉基因苗的建立 將種子去殼浸泡在濃度為65%的乙醇溶液中20s，取出后吸干水分，放入升汞溶液中，20分鐘后沖洗掉升汞。將洗干凈的種

23、子吸干水分，放入培養(yǎng)基中培養(yǎng)，等待種子發(fā)芽。兩周后長出愈傷組織，但生長出的愈傷組織很不規(guī)則，則需要進行兩次約為20個小時的繼代培養(yǎng)，便可以長出微黃色的形狀規(guī)則的胚性愈傷組織。此時先后放入預分化培養(yǎng)基和分化培養(yǎng)基中培養(yǎng)，分別為14天和20天，此時會生長出分化的幼苗。統(tǒng)計各個品種愈傷組織中誘導和分化的比例。 農桿菌介導的水稻轉化體系如下： 1）菌液準備：將帶有CRISPR/CAS9載體的EHA105農桿菌制成菌懸液，進行梯度稀釋，稀釋完成后涂布祖平板上，培養(yǎng)一段時間，挑取菌落在新培養(yǎng)基上培養(yǎng)，放置備用。 2）植物體備用：取植株的愈傷組織，切成1cm的小塊。取用時要輕拿輕放，防止愈傷組織有破損

24、。 3）滅菌和培養(yǎng)：將培養(yǎng)基放入0.103MPa、121℃、20min高壓蒸汽滅菌。將愈傷組織放入滅菌好的培養(yǎng)基中培養(yǎng)。經常觀察植株生長情況，期間如果植株不生長要更換培養(yǎng)基。每天記錄生長情況 4）篩選和檢測：分別取被侵染培養(yǎng)3天的愈傷組織和滅菌7天的水稻愈傷組織轉移到含有25mg/L的潮霉素篩選培養(yǎng)基上，用篩選培養(yǎng)基繼代培養(yǎng)，平均每兩周一次。培養(yǎng)過程中會有部分愈傷組織死亡，選取存活部分培養(yǎng)1-2次，培養(yǎng)完成后放入分化培養(yǎng)基中分化培養(yǎng)，大約15-20天左右即可分化出淡黃色的幼苗，再將幼苗小心放入生根培養(yǎng)基培養(yǎng)20天獲得植株。再用PCR技術測其序列，確認基因是否重組。統(tǒng)計各個表型的植株的數

25、量，并選出表型最佳的植株。 2.3.2轉基因苗子鑒定分析 按 Edwards et al(1991)且稍有改進的 CTAB 法提取轉基因材料的 DNA。用PCR法進行分子鑒定。PCR 反應體系采用 10μL 體系：包括20 ng/μl DNA 1.00μL，10×PCR buffer（含 Mg2+）1.00μL，10 mmol/L dNTP 0.75μL，2μmol/L Primer 1.00μL，5 U/μL Taq DNA polymerase 0.25 μL，最后加 ddH2O 6.00μL。擴增程序為：94℃預變性 5 min，55-65℃（根據不同反應）退火 30 s，72℃延伸

26、 1 min 后回到 95℃變性 30 s，共循環(huán) 37 次左右；然后 72℃ 延伸 10 min，待溫度降至 10℃以下，取出用于電泳。采用1%瓊脂糖凝膠電泳鑒定轉基因事件；用6%的聚丙烯酰胺 (Acrilamide) 凝膠電泳和銀染法檢測目標基因編輯事件，聚丙烯酰胺凝膠電泳電泳和染色方法按Panaud et al.1996描述的方法進行。 2.3.3水稻香味的鑒定方法 采用1.7% KOH浸泡法和咀嚼法兩種方法來驗證鑒定改良水稻植株的香味。 (1) 1.7% KOH浸泡法鑒定香味：將水稻葉片剪成1cm左右置于10mL試管中，倒入約8mL 1.7% KOH溶液浸泡，同時蓋緊管口，10m

27、in后打開管口，即可辨別出是否有香氣逸出。 (2) 咀嚼法鑒定香味：取1粒米于口中，仔細咀嚼品嘗，用鼻子吸一口氣，然后呼氣，即可辨別出是否有香氣呼出。此方法需要反復試驗，一般連續(xù)2-3次咀嚼即可完成一個樣品的鑒定，檢驗第二個樣品前須漱口。 3. 結果與分析 3.1 YN6香味基因的序列分析 我們首先比較了水稻YN6和稻花香2號香味基因自起始密碼子上游3kb處到終止密碼子間的基因序列，確定了YN6的香味基因Badh2基因與稻花香品種在DNA序列第7外顯子上存在序列差異，其余序列部分兩者之間完全一致。序列差異情況與文獻報道情況一致，如圖3.1A所示，其中稻花香在OsBadh2第7外顯子存在

28、短序列缺失，造成移碼突變。據此，我們認為，通過失活YN6的OsBadh2基因，將可能改良該品種的香味品質。 3.2載體的構建及分析 根據上述的序列分析，我們在YN6的OsBadh2基因第2外顯子處選取了一段序列作為CRISPR/CAS9酶識別和編輯位點，如圖3.1B所示。CRISPR/CAS9識別序列為：L-arm: GCTGGATGCTTTGAGT A 構建識別目標編輯位點的左側序列的CRISPR/CAS9載體 (L-CRISPR/CAS9 vector)，其對應的氨基酸序列設計如下: L-sequence:

29、圖3.1 YN6香味基因序列分析及轉化CRISPR/CAS9載體的構建 Figure 3.1 The sequence analysis of fragrance gene in YN6 and the schedule of transform-CRISPR/CAS9 vector construction CRISPR/CAS9識別序列為：R-arm：GCCTTTTGTCCAAGGA T 構建識別目標編輯位點的右側序列的CRISPR/CAS9載體 (R-CRISPR/CAS9 vector)，其對應的氨基酸序列設計如下: R-sequence: 上述識別目標編輯位點的左右兩

30、側序列的CRISPR/CAS9載體示意圖如圖3.1 b，c 對上述的構建好的轉化CRISPR/CAS9載體進行SacI，出現預期的兩條帶，大小分別為包含R-sequence的4kb片段和轉化CRISPR/CAS9栽體的其它序列12?kb（如圖3.1d）。對上述兩片段進行瓊脂糖凝膠電泳回收純化，并進行測序分析，與預期的結果完全一致，表明轉化CRISPR/CAS9載體構建成功。 4. 討論 4.1選擇CRISP/CAS技術構建載體 和傳統(tǒng)的誘變技術相比較，基因定點編輯技術完全可以按照我們的意愿去對任意位點進行誘變。另外，修飾后的基因會隨染色體DNA復制而進行復制，進而進行遺傳，這也有便于后

31、續(xù)的實驗統(tǒng)計與觀察研究。近年來CRISP/CAS技術以其獨特的優(yōu)勢得以迅速發(fā)展，CRISP/CAS技術由于其簡單的技術原理和實驗操作等優(yōu)點，這個技術對細胞的要求不是那么嚴格，所以可以應用到各種物種和所有的體外培養(yǎng)的細胞。這一技術是目前應用最廣，效率較高，最具有實踐應用前景的基因打靶技術。在糧食作物和各種經濟物種中，利用CRISP/CAS可以人為的改變任意性狀，從而培育出我們所需要的，含有各種好性狀的超級植物。同時，CRISP/CAS技術也可以應用到醫(yī)學研究方面，建立突變體庫，為人類的疾病是如何發(fā)生的以及怎樣發(fā)展的提供依據。 但是，這一技術仍然存在缺點，它會引起細胞的兩種修復機制，從而也會發(fā)生

32、一些有違我們意愿的突變，另外，也會出現概率極少的不能識別目標基因位點的現象。但是，這一技術仍然具有巨大潛力，我們有理由相信，隨著科技的發(fā)展，這一技術必將會對科學界做出巨大的貢獻。 實驗有待進一步改進。最主要的是先保證選取的CRISP/CAS識別區(qū)域和載體的剪切的高效性。我們可以嘗試不同濃度的菌懸液優(yōu)化實驗環(huán)節(jié)中的每個方法及步驟，從而增加陽性植株的轉化效率。進而能夠得到足夠多的陽性植株，在保證陽性植株數量的前提下再進一步篩選出我們想要的定向編輯植株。 4.2基因定點編輯技術 在目前看來，要想在各種高等植物中采用這個技術獲得不菲成就，我們還要克服許多的問題。近年來，科學家們通過多種途徑不懈努

33、力和探索，已經取得了一些令人振奮的結果。一個具有參考價值的實驗為我們積攢了十分重要的數據和技術。就是借鑒大馬哈魚的基因打靶的成功經驗，并且成功篩選出最初我們設計想要得到的突變體，從而最終達到基因的定點編輯目的。這一實驗也為植物基因組的定點敲除，基因敲入和堿基的定點置換提供了巨大的參考意義。并且這一技術是目前最有利用價值的植物基因組定點編輯技術。 因為大多數基因功能的改變是由基因內部某一個或者某幾個堿基的突變而引起的，所以利用寡核苷酸介導基因的單堿基突變在植物育種中具有十分重要的理論和實踐利用價值。但是這一技術的修復的效率不穩(wěn)定和后期的篩選困難等缺陷大大的限制了該技術的發(fā)展與使用。在實驗操作中

34、我們還可以調節(jié)和控制基因遺傳過程中的相關路徑，如對相關中間代謝產物和相關酶進行改良，從而最終達到高效率的基因打靶目的。但是，我們也不得不考慮到事情的反方面，也就是這一技術也有可能對目標基因以外的其他有益基因進行修飾更改，從而造成一些優(yōu)良性狀的退化。 綜上所述，要想根據人們的意愿將一些植物的某些基因進行定點修飾、將兩種或多種有益基因進行結合，將不益于植株生長的基因替換掉，這些基因的定點編輯技術依然存在著我們預想不到的困難?？傊?，我們可以通過各種各樣的生物學理論的結合和生物實驗技術的合作，相信在未來，這個技術一定可以為我國的水稻育種提供不錯的作用。 4.3實驗展望 鑒于已成功獲得了YN6的B

35、adh2基因獲得了定點敲除的植株，并且已經證實產生了香味，再接下來的實驗中我們會對獲得的植株進行檢測，觀察其內的營養(yǎng)物質，并且檢測是否含有其他有害物質。檢測完成后應用孟德爾遺傳定律多培養(yǎng)幾代，計算出有香味表型的植株的遺傳概率，尋求一定的方法，找出能讓香味基因穩(wěn)定遺傳的親本組合。相信通過CRISP/CAS9技術不僅可以改良水稻的香味基因，還可以改良水稻的抗冷、抗病、抗旱等基因，來獲得生存穩(wěn)定易活的，產量高的，高品質的優(yōu)良水稻。 結論 根據水稻香味基因Badh2的表達機理，本試驗選取了Badh2基因的第七外顯子

36、一段序列作為CRISP/CAS9的識別和切割作用位點，運用酶切酶連方法將兩個識別位點成功地連接到了CRISP/CAS9骨架上，并將這對CRISP/CAS9骨架連接到表達載體上，最后成功的將這一表達載體運用電轉化法將其轉入到了農桿菌中，經PCR檢測，測序檢測挑選連接完全正確的載體待用。 利用實驗室的組織培養(yǎng)條件，無菌操作技術。經過前期的水稻愈傷細胞誘導培養(yǎng)，愈傷組織的侵染及清洗，最后成功的篩選出抗性愈傷組織并將其分化成苗，經過大田的栽培及田間的成功管理收獲種子。 經過PCR鑒定、尿素聚丙烯酰胺凝膠電泳鑒定、目標區(qū)域的基因組測序分析、KOH浸泡法和咀嚼法鑒定。成功篩選出了具有怡人香味的水稻品種

37、。經過測序分析YN6的Badh2基因發(fā)生了8個堿基的缺失，另一株發(fā)生了4個堿基的缺失和2個堿基的置換。從而使YN6水稻品種本身存在的Badh2基因發(fā)生了功能的缺失。使原本不具有香味的YN6品種獲得了香味表型。 參考文獻 [1]虞國平，朱鴻英.我國水稻生產現狀及發(fā)展對策研究[J].現代農業(yè)科技，2009(06):122-126+130. [2]楊揚，謝震澤，王軻，晏月明.水稻香味的遺傳研究進展[J].首都師范大學學報(自然科學版)，2010，31(03):24-29. [3]Cooked rice aroma and 2-acetyl-

38、1-pyrroline. Buttery R G，Ling L C，Juliano B O，et al. Journal of Agriculture . 1983 [4] Genetic analysis of aroma in rice landrace. Tomar J B，Prassad S C. Oryza . 1997 [5]唐傲，邵高能，胡培松.水稻香味基因的研究進展[J].中國稻米，2009(04):1-4. [6]程式華，胡培松.中國水稻科技發(fā)展戰(zhàn)略[J].中國水稻科學，2008(03):223-226. [7]林作敏. 弱極性香味成分提取及液質聯(lián)用分析方法研究[D]

39、.中國科學技術大學，2017. [8]單奇?zhèn)ィ卟氏?植物基因組編輯及衍生技術最新研究進展[J].遺傳，2015，37(10):953-973. [9]鄭小梅，張曉立，于建東，鄭平，孫際賓.CRISPR-Cas9介導的基因組編輯技術的研究進展[J].生物技術進展，2015，5(01):1-9+78-79. [10]Cas9 transcriptional activators for target specificity screening and paired nickases for cooperative genome engineering. Mali P，Aach J，Stra

40、nges P B，et al. Nature Biotechnology . 2013 [11]Multiplex and homologous recombination–mediated genome editing in Arabidopsis and Nicotiana benthamiana using guide RNA and Cas9. Li JF，Norville JE，Aach J，McCormack M，Zhang DN，Bush J，Church GM，Sheen J. Nature Biotechnology . 2013 [12]景潤春，盧洪.CRISPR/C

41、as9基因組定向編輯技術的發(fā)展與在作物遺傳育種中的應用[J].中國農業(yè)科學，2016，49(07):1219-1229. [13]馬興亮，劉耀光.植物CRISPR/Cas9基因組編輯系統(tǒng)與突變分析[J].遺傳，2016，38(02):118-125. [14]曾秀英，侯學文.CRISPR/Cas9基因組編輯技術在植物基因功能研究及植物改良中的應用[J].植物生理學報，2015，51(09):1351-1358. [15]趙海衛(wèi)，呂欣，尹文.CRISPR/Cas9系統(tǒng)——靶向基因組編輯的新策略[J].中國病原生物學雜志，2015，10(03):281-284. [16]解莉楠，宋鳳艷，張

42、旸.CRISPR/Cas9系統(tǒng)在植物基因組定點編輯中的研究進展[J].中國農業(yè)科學，2015，48(09):1669-1677. [17]李聰，曹文廣.CRISPR/Cas9介導的基因編輯技術研究進展[J].生物工程學報，2015，31(11):1531-1542. [18]劉志國.CRISPR/Cas9系統(tǒng)介導基因組編輯的研究進展[J].畜牧獸醫(yī)學報，2014，45(10):1567-1583. [19]方銳，暢飛，孫照霖，李寧，孟慶勇.CRISPR/Cas9介導的基因組定點編輯技術[J].生物化學與生物物理進展，2013，40(08):691-702. [20] 平文麗，李雪君，林

43、娟，丁燕芳，孫煥，孫計平.CRISPR/Cas9介導的基因組編輯技術及其在作物品種改良中的應用[J].中國農學通報，2016，32(05):16-22. [21]張濤，鄭家奎，徐建第，蔣開鋒，吳先軍，汪旭東.香稻品種的遺傳多樣性研究[J].中國農業(yè)科學，2008(03):625-635. [22]林光.香稻的發(fā)展現狀與研究進展[J].中國農學通報，2009，25(08):164-168. 16 致謝 在整整的大學四年中，我在黑龍江大學中經歷了豐富多彩的四年，在生活中，輔導員老師、同學、室友都給予了我很大的幫助，作為一個之前從未單獨生活的學生，有了他們的存在，讓我很快適應獨

44、立的生活，讓我學會了處世原則，學會了獨立自主，學會了做人做事的道理。在學習中，我系統(tǒng)地學習了生物方面的知識，從宏觀到微觀，從理論到實踐。經過老師的教導，我對生物知識產生了濃厚的興趣，我學會了專業(yè)的生物知識，并且培養(yǎng)了我的動手能力，對我未來的生活有深遠的影響。在本次論文的創(chuàng)作過程中，我的導師姜老師給予了我很大的幫助，從論文題目講解，到實驗過程中的幫助，到文章結構、文章格式的指導。姜老師都認真負責，使我的論文寫作較為順利。 在此，我要感謝的輔導員，我的同學，我的室友，是他們讓我的大學生活不會感到孤單。我要感謝我的老師，我的導師姜老師，是他們讓我學會了知識，讓我充實的度過了大學生活，讓我學會了知識，有了一技之長。最后我要感謝黑龍江大學給了我學習的平臺，能讓我遇到這些幫助過我的人。讓我步入社會開始一段嶄新的人生！ 17