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PubMed數(shù)據(jù)庫檢索系統(tǒng) PubMed重點 PubMed數(shù)據(jù)庫的建立維護機構 NCBINLM和NCBI的全稱和中文含義PubMed的文獻收錄范圍其對應的光盤數(shù)據(jù)庫 MEDLINE 和印刷型檢索工具的名稱 醫(yī)學索引 牙科文獻索引 國際護理索引 PubMed檢索方式 主題詞檢索 自由詞檢索 索引瀏覽檢索 字段限定檢索 邏輯組配檢索 截詞檢索 強制檢索 短語 PubMed檢索功能界面 基本檢索 主題詞檢索 期刊瀏覽 引文匹配 單篇引文和多篇引文 臨床咨詢 PubMed不同檢索界面的使用 強調不同檢索內容在哪個界面使用 檢索式的組配檢索 檢索式表達的內容 PubMed主題詞標引所用詞表 MeSHPubMed主題詞加權檢索的含義 主要主題詞 和擴展檢索的含義 主題詞及下位詞同時檢索 檢索結果中題錄的著錄格式 一 歷史與背景 INDEXMEDCUSMEDLINE MADLARSonline 美國國立醫(yī)學圖書館 NationalLibraryofMedicine NLM 建立并維護的一個大型的醫(yī)學文獻數(shù)據(jù)庫 屬于MADLARS檢索系統(tǒng)中使用頻率最高的數(shù)據(jù)庫 Medline數(shù)據(jù)庫收錄了自1966年以來70多個國家40多個語種的約4 300多種生物醫(yī)學期刊的題錄及文摘 其中80 以上為英文文獻 75 85 含有文摘 MEDLINE包括三種索引 醫(yī)學索引 IndexMedicus 牙科文獻索引 IndextoDentalLiterature 國際護理索引 InternationalNursingIndex MEDLIN數(shù)據(jù)庫涉及內容包括 基礎醫(yī)學 臨床醫(yī)學 護理學 口腔科學 獸醫(yī)學 衛(wèi)生保健 營養(yǎng)衛(wèi)生 職業(yè)衛(wèi)生 衛(wèi)生管理等 MEDLARSMEDLARS MedicalLiteratureAnalysisandRetrievalSystem 是美國國立醫(yī)學圖書館建立的大型生物醫(yī)學信息檢索系統(tǒng) 于20世紀60年代開始提供脫機檢索服務 70年代形成了第一個聯(lián)機檢索數(shù)據(jù)庫MEDLARSON LINE 首先將MEDLINE數(shù)據(jù)庫進行了聯(lián)機檢索 并很快建立了國際聯(lián)機檢索系統(tǒng) MEDLINECD MEDLINEWEB PubMed http www nlm nih gov pubmedhttp www ncbi nlm nih gov pubmed 一 PubMed簡介 一 數(shù)據(jù)庫建立和維護美國國立醫(yī)學圖書館下屬的生物技術信息中心 NationalCenterforBiotechnologyInformation NCBI 建立并維護 文獻類型 期刊論文 綜述 以及與其他數(shù)據(jù)資源鏈接 特點 提供原文獲取服務 二 PubMed數(shù)據(jù)庫來源1 MEDLINE主要收錄1966年至今的文獻 文獻標記中除了有PMID號和MEDLINEUI號外 還注有 PubMed indexedforMEDLINE 的說明 2 PreMEDLINE主要保存處于加工階段的文獻 PubMed Inprocess 3 直接提供的其它文獻記錄 這部分文獻記錄中只有PubMed識別碼 PMID 另外還有 PubMed inprocess 的說明 PubMed檢索方式PubMed主要提供以下幾種檢索方式 1 主題詞檢索 2 自由詞檢索 3 索引詞表檢索 4 字段限定檢索 二 PubMed檢索功能 Authoraddress AD Author AU Language LA JournalTitle TA EC RNNumber RN MeSHMajorTopic MAJR MeSHSubheadings SH MeSHTerms MH PublicationType PT TextWords TW Title TI Title Abstract TIAB 5 組配檢索 注意 布爾組配符號AND OR NOT需大寫 順序自左到右 6 截詞檢索transplant 7 強制檢索短語檢索 livercancer PubMed引文和期刊全文查詢功能由于PubMed與生物醫(yī)學文獻出版商聯(lián)合 使其作為檢索引用文獻以及鏈接這些出版商站點 獲取全文數(shù)據(jù)的一種工具 1 引文鏈接2 全文鏈接有收費全文 免費全文兩種形式 免費全文 出版商直接提供 PMC PubMedCenter 中心提供 三 PubMed主要功能 1 基本檢索功能 包括簡單檢索界面和高級檢索界面2 PubMedToolsSingleCitationMatcher 單篇引文匹配BatchCitationMatcher 批引文匹配ClinicalQueries 臨床咨詢Topic SpecificQueries 特殊主題咨詢 3 MoreResourcesMeSHDatabase 主題詞數(shù)據(jù)庫JournalsDatabase 期刊數(shù)據(jù)庫ClinicalTrials 臨床實驗數(shù)據(jù)庫 一 PubMed主要檢索功能 簡單檢索 高級檢索 限定檢索 四 PubMed檢索 PubMed的自動轉換PubMed提供詞語的自動轉換 AutomaticTermMapping 功能 在基本檢索狀態(tài)下 如果輸入的檢索詞是不加限制的 PubMed利用該功能 實現(xiàn)MeSH 刊名 短語的轉換和著者的自動轉換 通過 SearchDetails 可查看轉換結果 轉換詞表 MeSH轉換表刊名轉換表短語列表著者索引表 1 簡單檢索 Go 簡單檢索界面允許實現(xiàn)檢索詞的邏輯組配 截詞 和短語等檢索 但邏輯組配需用大寫 AND OR NOT 詞匯聯(lián)想功能 舉例 1 badbreath2 badbreathcauses3 badbreath 4 lungcancerANDsmok 查找作者 輸入作者的姓 lastname 和名 firstinitial 中間不用標點符號 例 alvingc結果包括AlvingCRAlvingCJ等 高級檢索 Advancedsearch 在該界面 可以進行字段檢索 索引檢索 并提供察看檢索歷史等功能 Preview 顯示所輸入檢索式的檢索記錄數(shù) 檢索歷史 限定字段 檢索歷史 索引檢索 直接顯示檢索結果數(shù)量 字段限定檢索 舉例 檢索近5年嬰幼兒 巨細胞病毒感染與聽力損傷 方面文獻 cytomegalovirus Hearingloss 字段限定為 題目摘要 索引詞表檢索 Index Index 即利用數(shù)據(jù)庫中索引詞表進行檢索 該界面可以對不同的字段進行索引和檢索 并提供邏輯組配檢索功能 舉例 1 AddtoHistory功能演示 endometriosis2 Index downssyndrom e down ssyndrom e downsyndrom e 3 p16和p53在肝癌中的表達 對檢索結果的限定條件可以進行出版時間 語種 文獻類型 年齡 性別等方面的限定 以進一步縮小檢索范圍 進行限制后只能檢索medline中的內容 inprocess and suppliedbypublisher 因還沒有進行字段制作 不能檢索到 一旦勾選了某種限定條件 對后面的檢索詞語一直限定 除非取消 舉例 查找近兩年有關子宮內膜異位癥的綜述文獻 endometriosisendometriosis限定在題目摘要字段 查找近10年發(fā)表在 Obstetricsandgynecology 雜志上的有關子宮內膜異位癥的臨床試驗文獻 History檢索史回顧檢索歷史察看檢索過的所有檢索式重新編輯組合檢索式進行新的檢索 練習 1 在基本檢索界面分別輸入下列詞語并點擊 Details 察看結果 badbreath badbreathcauses badbreath lungcancerANDsmok 2 檢索 p16在肝癌中的表達 方面的文獻限定人類 五年 免費全文 英文中文 練習 限定和索引綜合應用 嬰幼兒巨細胞病毒感染與聽力損傷 cytomegalovirus Hearingloss 檢索PubMed收錄青島大學醫(yī)學院2000年以來所發(fā)表的文獻 二 主題詞檢索 進入方式 1 在高級檢索的最下方 MoreResources 有鏈接 2 在主頁面中 MoreResources 有鏈接 利用MEDLINE主題詞 副主題詞檢索 并可提供多個主題詞之間的邏輯組配檢索 注意 PubMed中的MeSH檢索將查不到referencesinprocess或thepublishersuppliedreferences中的記錄 因為這些記錄還未標引MeSH詞 主題詞檢索有時會漏檢最新出版 發(fā)表的文獻 為查找到有關某一主題的相關文獻 需要同時需采用自由詞和主題詞結合檢索 使用該功能可選擇規(guī)范化主題詞 副主題詞 查看詞義注釋 瀏覽樹狀結構表等 可執(zhí)行主題詞檢索 可以提高檢索效率 在MeSHDatabase的檢索框中 輸入檢索詞 如果不是MeSH詞 系統(tǒng)將提供同義或近義MeSH給于選擇 同時顯示MeSH樹 例 主題詞檢索界面的輸入框內輸入livercancer 點擊GO按扭 系統(tǒng)提示livercancer不是MeSH詞 規(guī)范主題詞應該是liverneoplasms 點擊主題詞liverneoplasms 顯示副主題詞 可供選擇 系統(tǒng)同時還顯示檢索的限定 如主要主題詞限定 限制下位詞擴檢 系統(tǒng)同時還顯示其樹狀結構表 用liverneoplasms選擇副主題詞radiotherapy therapy 點擊Addtosearchbuilder添加到檢索框中 點擊SearchPubMed進行檢索 見后頁 舉例P16和P53在肝癌中的表達 練習檢索近兩年重點研究 前列腺癌診斷 的文獻 Prostatecancer要求 主要主題詞檢索 將檢索時間限定在近兩年 三 臨床咨詢 是一個關于臨床治療 診斷 病因和預后四個方面的臨床文獻查詢界面 舉例 檢索癲癇 epilepsy 的治療方面的文獻 四 期刊瀏覽檢索 查詢特定期刊及特定期刊論文的檢索界面 點擊主頁面的Journalsdatabase按扭 系統(tǒng)轉到期刊數(shù)據(jù)庫首頁界面 期刊數(shù)據(jù)庫 可通過刊名全稱 刊名簡稱 Medline縮寫格式 ISSN號 刊名中的單個或若干個詞來查找特定的期刊 點擊界面中部的linkstofull textwebsites將列出與PubMed有全文鏈接的期刊刊名 按字順排列 可查找期刊中的文獻 舉例 在檢索框中輸入 science 查找某期刊中的文獻 1 基本檢索界面下 刊名可輸入全稱 或MEDLINE認可的標準縮寫形式 以及ISSN 如Molecularbiologyofthecell2 利用 Journalsdatabase 3 利用 singlecitationmatcher 如何查找在 science 雜志上發(fā)表的文獻 1 在高級檢索界面 science限定字段 Journal 2 在期刊檢索界面 science 選中 sendtosearchbox search3 在期刊名字的右邊的Links按鈕 點擊 PubMed 檢索該刊中的文獻 五 引文匹配提供通過已知的文獻線索 查詢特定文獻的摘要 作者 文獻題目等信息 包括單篇引文匹配和成匹引文匹配兩個界面 檢索TangBK在 BiochemicalPharmacology 雜志第29卷第14期上發(fā)表的文章 要求 用單篇引文匹配檢索 練習 1 期刊檢索查找在 AdvCancerRes 雜志上發(fā)表的文章 2 引文匹配檢索 要求寫出其他合著者和找到全文 BrownBK etal Monoclonalantibodiestohosphatidylinositolphosphateneutralizehumanimmunodeficiencyvirustype1 roleofphosphate bindingsubsites JVirol 2007Feb 81 4 2087 91 Epub2006Dec6 SpecialQueries 檢索結果顯示和下載 文獻顯示格式 summary xml abstracts citation medline文獻排序方式 sortby 時間 作者 期刊 每屏顯示文獻數(shù)量 show20 500 文獻輸出sendto 練習 檢索有關用losartan reserpine兩種藥物聯(lián)合治療 高血壓 hypertension 的文獻 要求1 用詞表下位詞擴展檢索 要求2 對檢索結果先用一個Web頁顯示 然后用一個文件保存下來 PubMed個性化服務 MyNCBIPubMed提供個性化服務功能 需要進行免費注冊 注冊后即可利用該服務 內容包括 文獻過濾顯示功能保存檢索式定題服務